Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS1P54277 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PMS1P54277 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS1P54277 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS1P54277 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS1P54277 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS1P54277 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms