Protein–RNA interactions for Protein: P46965

SPC1, Signal peptidase complex subunit SPC1, yeastyeast

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC1P46965 AFR1YDR085C 1863 nt0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 CHZ1YER030W 462 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 MIC19YFR011C 513 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 RSM27YGR215W 333 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 IMP3YHR148W 552 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 CRG1YHR209W 876 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YLR042CYLR042C 486 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YCL046WYCL046W 324 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 NGG1YDR176W 2109 nt0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 SBH1YER087C-B 249 nt0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 RPL37AYLR185W 267 nt0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 COX8YLR395C 237 nt0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 snR13snR13 124 nt0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 GPI2YPL076W 843 nt0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 COX12YLR038C 252 nt0□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0□□□□□ -2.41
SPC1P46965 CCE1YKL011C 1062 nt-0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 SDH2YLL041C 801 nt-0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 PHO80YOL001W 882 nt-0.01□□□□□ -2.41
SPC1P46965 NUT1YGL151W 3399 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 PDE2YOR360C 1581 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 VIK1YPL253C 1944 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 OCA6YDR067C 675 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 RAD6YGL058W 519 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 SAY1YGR263C 1275 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 SLI15YBR156C 2097 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC1P46965 BUL2YML111W 2763 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 UBC9YDL064W 474 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 SWI5YDR146C 2130 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 ROX1YPR065W 1107 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 YPR142CYPR142C 564 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 MKT1YNL085W 2493 nt-0.03□□□□□ -2.41
SPC1P46965 SGD1YLR336C 2700 nt-0.04□□□□□ -2.42
SPC1P46965 RPL26BYGR034W 384 nt-0.04□□□□□ -2.42
SPC1P46965 RPL42BYHR141C 321 nt-0.04□□□□□ -2.42
SPC1P46965 BET4YJL031C 984 nt-0.04□□□□□ -2.42
SPC1P46965 YMR324CYMR324C 243 nt-0.04□□□□□ -2.42
SPC1P46965 RPL42AYNL162W 321 nt-0.04□□□□□ -2.42
SPC1P46965 YBR184WYBR184W 1572 nt-0.05□□□□□ -2.42
SPC1P46965 YPR153WYPR153W 423 nt-0.05□□□□□ -2.42
SPC1P46965 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.06□□□□□ -2.42
SPC1P46965 WAR1YML076C 2835 nt-0.06□□□□□ -2.42
SPC1P46965 RTR2YDR066C 591 nt-0.06□□□□□ -2.42
SPC1P46965 ISD11YER048W-A 285 nt-0.06□□□□□ -2.42
SPC1P46965 PFS1YHR185C 714 nt-0.06□□□□□ -2.42
SPC1P46965 YKL115CYKL115C 393 nt-0.06□□□□□ -2.42
SPC1P46965 snR45snR45 172 nt-0.06□□□□□ -2.42
SPC1P46965 SRP14YDL092W 441 nt-0.07□□□□□ -2.42
SPC1P46965 SCW11YGL028C 1629 nt-0.07□□□□□ -2.42
SPC1P46965 CHS6YJL099W 2241 nt-0.07□□□□□ -2.42
SPC1P46965 BFR2YDR299W 1605 nt-0.08□□□□□ -2.42
SPC1P46965 SMD2YLR275W 333 nt-0.08□□□□□ -2.42
SPC1P46965 SPR2YOR214C 711 nt-0.08□□□□□ -2.42
SPC1P46965 YBR051WYBR051W 351 nt-0.08□□□□□ -2.42
SPC1P46965 NPR2YEL062W 1848 nt-0.08□□□□□ -2.42
SPC1P46965 GEP7YGL057C 864 nt-0.09□□□□□ -2.42
SPC1P46965 RFA3YJL173C 369 nt-0.09□□□□□ -2.42
SPC1P46965 RUF22RUF22 515 nt-0.09□□□□□ -2.42
SPC1P46965 ATP15YPL271W 189 nt-0.09□□□□□ -2.42
SPC1P46965 PKH2YOL100W 3246 nt-0.09□□□□□ -2.42
SPC1P46965 MMS4YBR098W 2076 nt-0.1□□□□□ -2.43
SPC1P46965 YGR242WYGR242W 309 nt-0.1□□□□□ -2.43
SPC1P46965 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt-0.1□□□□□ -2.43
SPC1P46965 PEX34YCL056C 435 nt-0.1□□□□□ -2.43
SPC1P46965 SLD3YGL113W 2007 nt-0.1□□□□□ -2.43
SPC1P46965 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.11□□□□□ -2.43
SPC1P46965 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.11□□□□□ -2.43
SPC1P46965 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.11□□□□□ -2.43
SPC1P46965 YOR053WYOR053W 342 nt-0.11□□□□□ -2.43
SPC1P46965 PRP5YBR237W 2550 nt-0.11□□□□□ -2.43
SPC1P46965 IES5YER092W 378 nt-0.12□□□□□ -2.43
SPC1P46965 ALY2YJL084C 3141 nt-0.12□□□□□ -2.43
SPC1P46965 HDA3YPR179C 1968 nt-0.12□□□□□ -2.43
SPC1P46965 REF2YDR195W 1602 nt-0.13□□□□□ -2.43
SPC1P46965 YOR282WYOR282W 321 nt-0.13□□□□□ -2.43
SPC1P46965 PET111YMR257C 2403 nt-0.13□□□□□ -2.43
SPC1P46965 COG8YML071C 1824 nt-0.13□□□□□ -2.43
SPC1P46965 KAR3YPR141C 2190 nt-0.13□□□□□ -2.43
SPC1P46965 PRP39YML046W 1890 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC1P46965 RPL9AYGL147C 576 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC1P46965 MRPL50YNR022C 420 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC1P46965 LOA1YPR139C 903 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC1P46965 YPR172WYPR172W 603 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC1P46965 MLP1YKR095W 5628 nt-0.15□□□□□ -2.43
SPC1P46965 YLR232WYLR232W 348 nt-0.15□□□□□ -2.43
SPC1P46965 YOP1YPR028W 543 nt-0.15□□□□□ -2.43
SPC1P46965 KAR1YNL188W 1302 nt-0.15□□□□□ -2.43
SPC1P46965 snR190snR190 190 nt-0.16□□□□□ -2.44
SPC1P46965 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt-0.17□□□□□ -2.44
SPC1P46965 RPS16AYMR143W 432 nt-0.17□□□□□ -2.44
SPC1P46965 MLP2YIL149C 5040 nt-0.18□□□□□ -2.44
SPC1P46965 YAR053WYAR053W 297 nt-0.18□□□□□ -2.44
SPC1P46965 RPL26AYLR344W 384 nt-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 82.4 ms