Protein–RNA interactions for Protein: P25367

RNQ1, [PIN+] prion protein RNQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1P25367 FUN30YAL019W 3396 nt2.74□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 SPT16YGL207W 3108 nt2.74□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 FLO10YKR102W 3510 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 YIL169CYIL169C 2988 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 ILS1YBL076C 3219 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 RSN1YMR266W 2862 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 SOM1YEL059C-A 225 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 CDC31YOR257W 486 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 YPL044CYPL044C 549 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 VPS34YLR240W 2628 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 SOK1YDR006C 2706 nt2.73□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 CCM1YGR150C 2595 nt2.72□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 STF2YGR008C 255 nt2.72□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 FIG4YNL325C 2640 nt2.72□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 YSP2YDR326C 4317 nt2.72□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 SPO75YLL005C 2607 nt2.72□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 TOP1YOL006C 2310 nt2.71□□□□□ -1.97
RNQ1P25367 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 RPA190YOR341W 4995 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 KAP95YLR347C 2586 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YLR149CYLR149C 2193 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 CHS3YBR023C 3498 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 PEP3YLR148W 2757 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 CTF4YPR135W 2784 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 XRN1YGL173C 4587 nt2.71□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 NOC3YLR002C 1992 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 ERB1YMR049C 2424 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 GRR1YJR090C 3456 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 APL5YPL195W 2799 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 TAF6YGL112C 1551 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 MPH1YIR002C 2982 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 PSK2YOL045W 3306 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 SEC15YGL233W 2733 nt2.7□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 FAR1YJL157C 2493 nt2.69□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 HOS4YIL112W 3252 nt2.69□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 PXA2YKL188C 2562 nt2.69□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 ATG13YPR185W 2217 nt2.69□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YDL118WYDL118W 381 nt2.69□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 PHD1YKL043W 1101 nt2.69□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 PFF1YBR074W 2931 nt2.69□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.68□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 snR43snR43 209 nt2.68□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.68□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 RPN1YHR027C 2982 nt2.68□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 BUB1YGR188C 3066 nt2.68□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 NIP100YPL174C 2607 nt2.68□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YOR019WYOR019W 2193 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 GIS1YDR096W 2685 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 RCY1YJL204C 2523 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 PHO81YGR233C 3537 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 SAK1YER129W 3429 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 SQS1YNL224C 2304 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 UBP14YBR058C 2346 nt2.67□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YNL144CYNL144C 2223 nt2.66□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 SPC98YNL126W 2541 nt2.66□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 MSC6YOR354C 2079 nt2.66□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 YBL012CYBL012C 402 nt2.66□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 SEF1YBL066C 3447 nt2.65□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 VPS35YJL154C 2835 nt2.65□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 DNA2YHR164C 4569 nt2.65□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 PMR1YGL167C 2853 nt2.65□□□□□ -1.98
RNQ1P25367 ITC1YGL133W 3795 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 AIM44YPL158C 2277 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 RAX2YLR084C 3663 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 SPO14YKR031C 5052 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 RPL31AYDL075W 342 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YDL242WYDL242W 354 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 SWI6YLR182W 2412 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 VBA4YDR119W 2307 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 PBY1YBR094W 2262 nt2.65□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 RSE1YML049C 4086 nt2.64□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.64□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YJL120WYJL120W 324 nt2.64□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 RPS25BYLR333C 327 nt2.64□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 BUD4YJR092W 4344 nt2.64□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 SLN1YIL147C 3663 nt2.63□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 TCB2YNL087W 3537 nt2.63□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 POM152YMR129W 4014 nt2.63□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 MYO5YMR109W 3660 nt2.63□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YCR043CYCR043C 384 nt2.62□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 PAU3YCR104W 375 nt2.62□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 FMP16YDR070C 282 nt2.62□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 RPL42BYHR141C 321 nt2.62□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 AI2Q0055 2565 nt2.62□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 YCL019WYCL019W 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 BOI1YBL085W 2943 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.61□□□□□ -1.99
RNQ1P25367 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.9 ms