Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL2P13500 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL2P13500 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL2P13500 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL2P13500 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms