Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms