Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q3C1V9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q3C1V9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q3C1V9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q3C1V9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3C1V9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3C1V9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3C1V9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms