Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HIF1AQ16665 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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