Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 RRP12YPL012W 3687 nt2.58□□□□□ -2
TAF3Q12297 CYB5YNL111C 363 nt2.58□□□□□ -2
TAF3Q12297 SPF1YEL031W 3648 nt2.58□□□□□ -2
TAF3Q12297 SIN3YOL004W 4611 nt2.58□□□□□ -2
TAF3Q12297 HDA3YPR179C 1968 nt2.58□□□□□ -2
TAF3Q12297 TRS65YGR166W 1683 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 MLH1YMR167W 2310 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 GCV2YMR189W 3105 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 snR76snR76 109 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 YGL052WYGL052W 306 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 HHT1YBR010W 411 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 RTC6YPL183W-A 282 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 YME2YMR302C 2553 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 UBP15YMR304W 3693 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 YEF3YLR249W 3135 nt2.57□□□□□ -2
TAF3Q12297 DIS3YOL021C 3006 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 YGR250CYGR250C 2346 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 ERP6YGL002W 651 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 YIL059CYIL059C 366 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 YBR197CYBR197C 654 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 YOL098CYOL098C 3114 nt2.56□□□□□ -2
TAF3Q12297 NPC2YDL046W 522 nt2.55□□□□□ -2
TAF3Q12297 YGL069CYGL069C 465 nt2.55□□□□□ -2
TAF3Q12297 YJL150WYJL150W 303 nt2.55□□□□□ -2
TAF3Q12297 BFA1YJR053W 1725 nt2.55□□□□□ -2
TAF3Q12297 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.55□□□□□ -2
TAF3Q12297 RGM1YMR182C 636 nt2.55□□□□□ -2
TAF3Q12297 YPR063CYPR063C 423 nt2.55□□□□□ -2
TAF3Q12297 BAS1YKR099W 2436 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 PDR1YGL013C 3207 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 IPT1YDR072C 1584 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 KTI11YBL071W-A 249 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 FPR1YNL135C 345 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 YNL170WYNL170W 396 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 NCL1YBL024W 2055 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 YJL070CYJL070C 2667 nt2.54□□□□□ -2
TAF3Q12297 SVL3YPL032C 2478 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YDR426CYDR426C 378 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YEL014CYEL014C 306 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 LSM7YNL147W 348 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 YPL150WYPL150W 2706 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 SCW11YGL028C 1629 nt2.53□□□□□ -2
TAF3Q12297 RSE1YML049C 4086 nt2.52□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 DFG16YOR030W 1860 nt2.52□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 DBP10YDL031W 2988 nt2.52□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 RPL23BYER117W 414 nt2.52□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 ORC1YML065W 2745 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 PAN3YKL025C 2040 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 MPH1YIR002C 2982 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 PCC1YKR095W-A 267 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 UPS1YLR193C 528 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YML037CYML037C 1023 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 TRA1YHR099W 11235 nt2.51□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 VIK1YPL253C 1944 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 SGD1YLR336C 2700 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 MRP10YDL045W-A 288 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 Q0143Q0143 153 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YNL028WYNL028W 318 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 SWA2YDR320C 2007 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 GUP1YGL084C 1683 nt2.5□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 ALK2YBL009W 2031 nt2.49□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.49□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 APC9YLR102C 798 nt2.49□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 GRX8YLR364W 330 nt2.49□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.49□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YMR321CYMR321C 318 nt2.49□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 CSE2YNR010W 450 nt2.49□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 NUM1YDR150W 8247 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 SDC25YLL016W 3147 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 PAU10YDR542W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 PAU11YGL261C 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 RPL38YLR325C 237 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 PAU4YLR461W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 TOF2YKR010C 2316 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 TRS130YMR218C 3309 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 PRP39YML046W 1890 nt2.48□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YOR015WYOR015W 360 nt2.47□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 CRS5YOR031W 210 nt2.47□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 YOR055WYOR055W 435 nt2.47□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 EDS1YBR033W 2760 nt2.47□□□□□ -2.01
TAF3Q12297 KSP1YHR082C 3090 nt2.46□□□□□ -2.02
TAF3Q12297 UBP11YKR098C 2154 nt2.46□□□□□ -2.02
TAF3Q12297 PRE4YFR050C 801 nt2.46□□□□□ -2.02
TAF3Q12297 OLI1Q0130 231 nt2.46□□□□□ -2.02
TAF3Q12297 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.46□□□□□ -2.02
TAF3Q12297 PTC5YOR090C 1719 nt2.45□□□□□ -2.02
TAF3Q12297 SSS1YDR086C 243 nt2.45□□□□□ -2.02
TAF3Q12297 VPS55YJR044C 423 nt2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.5 ms