Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 TIM10YHR005C-A 282 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 RPC10YHR143W-A 213 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 PGA1YNL158W 597 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 PET123YOR158W 957 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 MLH3YPL164C 2148 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 RAD9YDR217C 3930 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 VPS52YDR484W 1926 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YGR283CYGR283C 1026 nt1.18□□□□□ -2.22
USB1Q12208 UTP13YLR222C 2454 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 LAA1YJL207C 6045 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YDL016CYDL016C 303 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YDR029WYDR029W 315 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 SPO13YHR014W 876 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YIL029CYIL029C 429 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YLR252WYLR252W 306 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 GMC2YLR445W 567 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 UBX4YMR067C 1251 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 TIF11YMR260C 462 nt1.17□□□□□ -2.22
USB1Q12208 CDC36YDL165W 576 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 CHZ1YER030W 462 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YJR079WYJR079W 330 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YOL159CYOL159C 516 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 GPX2YBR244W 489 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 CDC25YLR310C 4770 nt1.16□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YLR149CYLR149C 2193 nt1.15□□□□□ -2.22
USB1Q12208 EST2YLR318W 2655 nt1.15□□□□□ -2.22
USB1Q12208 snR79snR79 84 nt1.15□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.15□□□□□ -2.23
USB1Q12208 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.15□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.15□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YKL111CYKL111C 336 nt1.15□□□□□ -2.23
USB1Q12208 PBY1YBR094W 2262 nt1.15□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YJR141WYJR141W 1044 nt1.14□□□□□ -2.23
USB1Q12208 IRC16YPR038W 360 nt1.14□□□□□ -2.23
USB1Q12208 RLM1YPL089C 2031 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 SNU56YDR240C 1479 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 MDS3YGL197W 4464 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 MSC6YOR354C 2079 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YCR043CYCR043C 384 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 DCP2YNL118C 2913 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 SGD1YLR336C 2700 nt1.13□□□□□ -2.23
USB1Q12208 PEP3YLR148W 2757 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 OCA6YDR067C 675 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 CIC1YHR052W 1131 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 AFB1YLR040C 675 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 SNF5YBR289W 2718 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.12□□□□□ -2.23
USB1Q12208 MSN5YDR335W 3675 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 MTC7YEL033W 420 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YJL022WYJL022W 309 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YKL044WYKL044W 321 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 RRT15YLR162W-A 189 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 CTK3YML112W 891 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 ALK1YGL021W 2283 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.11□□□□□ -2.23
USB1Q12208 AZF1YOR113W 2745 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 SMY1YKL079W 1971 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 SMB1YER029C 591 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 CRG1YHR209W 876 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 CGI121YML036W 546 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 PKR1YMR123W 369 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 RCN2YOR220W 798 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YPR146CYPR146C 330 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.1□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YGR130CYGR130C 2451 nt1.09□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.09□□□□□ -2.23
USB1Q12208 RPL42BYHR141C 321 nt1.09□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.09□□□□□ -2.23
USB1Q12208 COF1YLL050C 432 nt1.09□□□□□ -2.23
USB1Q12208 RPL42AYNL162W 321 nt1.09□□□□□ -2.23
USB1Q12208 YCL046WYCL046W 324 nt1.09□□□□□ -2.23
USB1Q12208 CDC24YAL041W 2565 nt1.08□□□□□ -2.24
USB1Q12208 HNT1YDL125C 477 nt1.08□□□□□ -2.24
USB1Q12208 BER1YLR412W 825 nt1.08□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SPO75YLL005C 2607 nt1.08□□□□□ -2.24
USB1Q12208 PPN1YDR452W 2025 nt1.08□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SMC4YLR086W 4257 nt1.08□□□□□ -2.24
USB1Q12208 AHC1YOR023C 1701 nt1.07□□□□□ -2.24
USB1Q12208 KAP122YGL016W 3246 nt1.07□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YER121WYER121W 345 nt1.07□□□□□ -2.24
USB1Q12208 SPC1YJR010C-A 285 nt1.07□□□□□ -2.24
USB1Q12208 VPS55YJR044C 423 nt1.07□□□□□ -2.24
USB1Q12208 FCF2YLR051C 654 nt1.07□□□□□ -2.24
USB1Q12208 MVP1YMR004W 1536 nt1.06□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YJR029WYJR029W 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
USB1Q12208 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
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