Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.58□□□□□ -2
VHS3Q08438 OSH6YKR003W 1347 nt2.58□□□□□ -2
VHS3Q08438 PDR1YGL013C 3207 nt2.58□□□□□ -2
VHS3Q08438 INP53YOR109W 3324 nt2.57□□□□□ -2
VHS3Q08438 YGL149WYGL149W 306 nt2.57□□□□□ -2
VHS3Q08438 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.57□□□□□ -2
VHS3Q08438 SPF1YEL031W 3648 nt2.57□□□□□ -2
VHS3Q08438 SOK2YMR016C 2358 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 HTL1YCR020W-B 237 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 RBK1YCR036W 1002 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 YGL069CYGL069C 465 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 YOR055WYOR055W 435 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 snR51snR51 107 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 ORC2YBR060C 1863 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 PAN3YKL025C 2040 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 TOF2YKR010C 2316 nt2.56□□□□□ -2
VHS3Q08438 YIL059CYIL059C 366 nt2.55□□□□□ -2
VHS3Q08438 HTB2YBL002W 396 nt2.55□□□□□ -2
VHS3Q08438 TAE2YPL009C 3117 nt2.55□□□□□ -2
VHS3Q08438 YOP1YPR028W 543 nt2.55□□□□□ -2
VHS3Q08438 MMS22YLR320W 4365 nt2.55□□□□□ -2
VHS3Q08438 UBR1YGR184C 5853 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 SIR3YLR442C 2937 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 PTP3YER075C 2787 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 PEX4YGR133W 552 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 KTI11YBL071W-A 249 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 RPS12YOR369C 432 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 PDR11YIL013C 4236 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 RAV1YJR033C 4074 nt2.54□□□□□ -2
VHS3Q08438 KAP123YER110C 3342 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 SVL3YPL032C 2478 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 CBF2YGR140W 2871 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 YDR186CYDR186C 2634 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 VMA9YCL005W-A 222 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 DFG16YOR030W 1860 nt2.53□□□□□ -2
VHS3Q08438 MLH1YMR167W 2310 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 GIS1YDR096W 2685 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 TMN3YER113C 2121 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 HOP2YGL033W 657 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 COA4YLR218C 453 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 GIP3YPL137C 3831 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 ISW1YBR245C 3390 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 GUP1YGL084C 1683 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 AFI1YOR129C 2682 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YEL043WYEL043W 2871 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YDR048CYDR048C 315 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YHL041WYHL041W 450 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YJL015CYJL015C 285 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 RPA34YJL148W 702 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 SAR1YPL218W 573 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 RRP6YOR001W 2202 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 SPO22YIL073C 2928 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 ALK2YBL009W 2031 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 RIC1YLR039C 3171 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YLR149CYLR149C 2193 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 CSF1YLR087C 8877 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 KRE33YNL132W 3171 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 RIM20YOR275C 1986 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 PRE4YFR050C 801 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 EMC6YLL014W 327 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 PAU8YAL068C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 RPL38YLR325C 237 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 PAU20YOL161C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YBR224WYBR224W 516 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 CRM1YGR218W 3255 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 CDC27YBL084C 2277 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 LYS9YNR050C 1341 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 PHO2YDL106C 1680 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YDR344CYDR344C 444 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 SPG3YDR504C 384 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 SNC1YAL030W 354 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 SEF1YBL066C 3447 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 SMY1YKL079W 1971 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 TIM9YEL020W-A 264 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 CYC7YEL039C 342 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YIL102CYIL102C 306 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 HHT1YBR010W 411 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 YBR184WYBR184W 1572 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 STE11YLR362W 2154 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 PEP3YLR148W 2757 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 VPS13YLL040C 9435 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 STB4YMR019W 2850 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS3Q08438 PEX8YGR077C 1770 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 DBP6YNR038W 1890 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 CDC53YDL132W 2448 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.46□□□□□ -2.02
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