Protein–RNA interactions for Protein: Q04119

PPN1, Endopolyphosphatase, yeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPN1	Q04119	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.52	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	PAN3	YKL025C	2040 nt		2.52	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.51	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	TAE2	YPL009C	3117 nt		2.51	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.51	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	SNU114	YKL173W	3027 nt		2.51	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	INP53	YOR109W	3324 nt		2.51	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.51	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.51	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.5	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	HMRA2	YCR096C	360 nt		2.5	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	YHL041W	YHL041W	450 nt		2.5	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	SNC1	YAL030W	354 nt		2.5	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	IRA2	YOL081W	9240 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	STB4	YMR019W	2850 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	OSH6	YKR003W	1347 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	AMS1	YGL156W	3252 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	HOS4	YIL112W	3252 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	TMN3	YER113C	2121 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	YHR063W-A	YHR063W-A	336 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	PDR11	YIL013C	4236 nt		2.49	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	HSC82	YMR186W	2118 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	RBK1	YCR036W	1002 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	LCL1	YPL056C	306 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	YBR224W	YBR224W	516 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	SLN1	YIL147C	3663 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	CSF1	YLR087C	8877 nt		2.48	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	RPA34	YJL148W	702 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	YLR154W-E	YLR154W-E	204 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	HTB2	YBL002W	396 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	SAR1	YPL218W	573 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	YOP1	YPR028W	543 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	OST1	YJL002C	1431 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	TOF2	YKR010C	2316 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.47	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.46	□□□□□ -2.01
PPN1	Q04119	YER079C-A	YER079C-A	339 nt		2.46	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	RPS27A	YKL156W	249 nt		2.46	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		2.46	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	GUP1	YGL084C	1683 nt		2.46	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	PSD2	YGR170W	3417 nt		2.46	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	SWA2	YDR320C	2007 nt		2.46	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	SOK2	YMR016C	2358 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	NUP170	YBL079W	4509 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YLR149C	YLR149C	2193 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	PRE4	YFR050C	801 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	RPS29A	YLR388W	171 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	DAD3	YBR233W-A	285 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	AFI1	YOR129C	2682 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	VTC3	YPL019C	2508 nt		2.45	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	CDC27	YBL084C	2277 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	RRP6	YOR001W	2202 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	VMR1	YHL035C	4779 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YDR048C	YDR048C	315 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YGL149W	YGL149W	306 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	MF(ALPHA)1	YPL187W	498 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.44	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	FAR11	YNL127W	2862 nt		2.43	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.43	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YNL018C	YNL018C	1839 nt		2.43	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	HTL1	YCR020W-B	237 nt		2.43	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	VMA9	YCL005W-A	222 nt		2.43	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	DFG16	YOR030W	1860 nt		2.43	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	SEF1	YBL066C	3447 nt		2.43	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	UBR1	YGR184C	5853 nt		2.42	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	PEP3	YLR148W	2757 nt		2.42	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.42	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YIL059C	YIL059C	366 nt		2.42	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	CDC53	YDL132W	2448 nt		2.42	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	ALK2	YBL009W	2031 nt		2.42	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	RIC1	YLR039C	3171 nt		2.42	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.41	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.41	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	YOR394C-A	YOR394C-A	168 nt		2.41	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	snR51	snR51	107 nt		2.41	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	EDS1	YBR033W	2760 nt		2.41	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	KAP123	YER110C	3342 nt		2.4	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	SPF1	YEL031W	3648 nt		2.4	□□□□□ -2.02
PPN1	Q04119	SCP160	YJL080C	3669 nt		2.4	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.4	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	ALG13	YGL047W	609 nt		2.4	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	CRM1	YGR218W	3255 nt		2.4	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	GIS1	YDR096W	2685 nt		2.4	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	MLH1	YMR167W	2310 nt		2.4	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	YBR184W	YBR184W	1572 nt		2.4	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	NOP53	YPL146C	1368 nt		2.39	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	YBL083C	YBL083C	426 nt		2.39	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	NUT2	YPR168W	474 nt		2.39	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	MGM1	YOR211C	2646 nt		2.39	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	DBP6	YNR038W	1890 nt		2.39	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	PEX8	YGR077C	1770 nt		2.38	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.38	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	PHO91	YNR013C	2685 nt		2.38	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	KRE33	YNL132W	3171 nt		2.38	□□□□□ -2.03
PPN1	Q04119	YDL062W	YDL062W	426 nt		2.38	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.8 ms