Protein–RNA interactions for Protein: Q02805

ROD1, Protein ROD1, yeastyeast

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROD1Q02805 YDR426CYDR426C 378 nt3.01□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 PAU2YEL049W 363 nt3.01□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 TRX1YLR043C 312 nt3.01□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 NET1YJL076W 3570 nt3.01□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 BUB1YGR188C 3066 nt3□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 MMS22YLR320W 4365 nt3□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 RSE1YML049C 4086 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 GIS4YML006C 2325 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 FLO1YAR050W 4614 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 ATP8Q0080 147 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 YLR255CYLR255C 354 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 CRS5YOR031W 210 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 YOR333CYOR333C 417 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 VPH1YOR270C 2523 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 RAX2YLR084C 3663 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 DUG2YBR281C 2637 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 LCD1YDR499W 2244 nt2.99□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 EFR3YMR212C 2349 nt2.98□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 GCV2YMR189W 3105 nt2.98□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 SMD1YGR074W 441 nt2.98□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 KAP123YER110C 3342 nt2.98□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 YPL150WYPL150W 2706 nt2.97□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.97□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 RGA2YDR379W 3030 nt2.97□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 RPN1YHR027C 2982 nt2.97□□□□□ -1.93
ROD1Q02805 SMY1YKL079W 1971 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YBR184WYBR184W 1572 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 UBP14YBR058C 2346 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 VPS55YJR044C 423 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 PHD1YKL043W 1101 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 CSE2YNR010W 450 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YOR302WYOR302W 78 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 STT4YLR305C 5703 nt2.96□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 UPS1YLR193C 528 nt2.95□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 RPL20AYMR242C 519 nt2.95□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 SDC25YLL016W 3147 nt2.95□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 RCY1YJL204C 2523 nt2.95□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 SEF1YBL066C 3447 nt2.95□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 FIR1YER032W 2631 nt2.95□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 RIC1YLR039C 3171 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YDR186CYDR186C 2634 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 RRP12YPL012W 3687 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 NOP10YHR072W-A 177 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YNL338WYNL338W 159 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 ATG13YPR185W 2217 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 SNF5YBR289W 2718 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 TAO3YIL129C 7131 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 RRM3YHR031C 2172 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 SUL1YBR294W 2580 nt2.94□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 CFT2YLR115W 2580 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YEL014CYEL014C 306 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.93□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 COS111YBR203W 2775 nt2.92□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 VIK1YPL253C 1944 nt2.92□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 VPS16YPL045W 2397 nt2.92□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.92□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 TAE2YPL009C 3117 nt2.92□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 SSN2YDR443C 4263 nt2.92□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 PEP3YLR148W 2757 nt2.91□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 RTT10YPL183C 3042 nt2.91□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YMR321CYMR321C 318 nt2.91□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 MDM20YOL076W 2391 nt2.91□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 YLR149CYLR149C 2193 nt2.91□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 RSN1YMR266W 2862 nt2.9□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 VPS34YLR240W 2628 nt2.9□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 CAF120YNL278W 3183 nt2.9□□□□□ -1.94
ROD1Q02805 snR70snR70 164 nt2.9□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 YOR170WYOR170W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 snR43snR43 209 nt2.9□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 TFC4YGR047C 3078 nt2.9□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 CRM1YGR218W 3255 nt2.9□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 SNQ2YDR011W 4506 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 GRR1YJR090C 3456 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 MET6YER091C 2304 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 OLI1Q0130 231 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 RRT15YLR162W-A 189 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 YBL065WYBL065W 345 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 SIN3YOL004W 4611 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 PLC1YPL268W 2610 nt2.89□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 NOP53YPL146C 1368 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 AFI1YOR129C 2682 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 BUD4YJR092W 4344 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 SSS1YDR086C 243 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 INP53YOR109W 3324 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 MUK1YPL070W 1839 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 TRS65YGR166W 1683 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 BCK1YJL095W 4437 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 CDC27YBL084C 2277 nt2.88□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 SCH9YHR205W 2475 nt2.87□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 PDE2YOR360C 1581 nt2.87□□□□□ -1.95
ROD1Q02805 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms