Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.67□□□□□ -2.3
SED1Q01589 SPR3YGR059W 1539 nt0.67□□□□□ -2.3
SED1Q01589 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.67□□□□□ -2.3
SED1Q01589 SMC1YFL008W 3678 nt0.67□□□□□ -2.3
SED1Q01589 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 OSH6YKR003W 1347 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 HTB1YDR224C 396 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 CWC23YGL128C 852 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 LAG1YHL003C 1236 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 PHS1YJL097W 654 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 UBS1YBR165W 834 nt0.66□□□□□ -2.3
SED1Q01589 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 HYM1YKL189W 1200 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SEC22YLR268W 645 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YMR324CYMR324C 243 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 BRX1YOL077C 876 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SPR2YOR214C 711 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 TIM18YOR297C 579 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 PEP3YLR148W 2757 nt0.65□□□□□ -2.31
SED1Q01589 IFH1YLR223C 3258 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YGL217CYGL217C 342 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 POL32YJR043C 1053 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 snR14snR14 160 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 NUP145YGL092W 3954 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SEC3YER008C 4011 nt0.64□□□□□ -2.31
SED1Q01589 CDC39YCR093W 6327 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 STB6YKL072W 2301 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 NHP2YDL208W 471 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 RTR2YDR066C 591 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 BUD26YDR241W 288 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 RSM28YDR494W 1086 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 RTR1YER139C 681 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 HIT1YJR055W 495 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YCS4YLR272C 3531 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 BUD3YCL014W 4911 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 KAP120YPL125W 3099 nt0.63□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SLX4YLR135W 2247 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SWI4YER111C 3282 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 MRPL32YCR003W 552 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 DAD1YDR016C 285 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 RCN1YKL159C 636 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 CMC4YMR194C-B 222 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 RPS7BYNL096C 573 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 FMP23YBR047W 528 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 NUP82YJL061W 2142 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SLS1YLR139C 1932 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 KAR1YNL188W 1302 nt0.62□□□□□ -2.31
SED1Q01589 RAD50YNL250W 3939 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SGD1YLR336C 2700 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 DPB11YJL090C 2295 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SEC5YDR166C 2916 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YDR521WYDR521W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 PAU2YEL049W 363 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 LSO2YGR169C-A 279 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 PAU12YGR294W 363 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 PAU18YLL064C 363 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 PAU6YNR076W 363 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 VAM3YOR106W 852 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SEC1YDR164C 2175 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 UTP20YBL004W 7482 nt0.61□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YMR160WYMR160W 2451 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SWT1YOR166C 1377 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 NUP157YER105C 4176 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 snR59snR59 78 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YDL068WYDL068W 330 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 LOC1YFR001W 615 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 VMA7YGR020C 357 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YGR265WYGR265W 411 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 RPL16AYIL133C 600 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SPC2YML055W 537 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 URA10YMR271C 684 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.6□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YCK3YER123W 1575 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 IRC2YDR112W 309 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 QCR9YGR183C 201 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57 ms