Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	RSM28	YDR494W	1086 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	EPT1	YHR123W	1176 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	TIF11	YMR260C	462 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	DBP6	YNR038W	1890 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	LAG1	YHL003C	1236 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	GRX8	YLR364W	330 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	YPL225W	YPL225W	441 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	CCL1	YPR025C	1182 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	UTP8	YGR128C	2142 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	snR63	snR63	255 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	LRS4	YDR439W	1044 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	NOP10	YHR072W-A	177 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	RPL9B	YNL067W	576 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	TRS20	YBR254C	528 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	APC5	YOR249C	2058 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	SLD3	YGL113W	2007 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
DDR2	P89113	SLD5	YDR489W	885 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YHR022C	YHR022C	771 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YOR199W	YOR199W	330 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	RPB10	YOR210W	213 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	HSH49	YOR319W	642 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YBR200W-A	YBR200W-A	165 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YBR221W-A	YBR221W-A	105 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	NTF2	YER009W	378 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	BRX1	YOL077C	876 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YBR012C	YBR012C	420 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YBR071W	YBR071W	636 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	COB	Q0105	1158 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	PRP42	YDR235W	1635 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	TRM12	YML005W	1389 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	AHC2	YCR082W	387 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	SDH2	YLL041C	801 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	RPI1	YIL119C	1224 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YCR102W-A	YCR102W-A	198 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YJR011C	YJR011C	786 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	SVS1	YPL163C	783 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	PSO2	YMR137C	1986 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	MLP1	YKR095W	5628 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	AEP3	YPL005W	1821 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	CCE1	YKL011C	1062 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	HYM1	YKL189W	1200 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	YTH1	YPR107C	627 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	BFR2	YDR299W	1605 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
DDR2	P89113	MSS4	YDR208W	2340 nt		-0.72	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	snR84	snR84	550 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YEL028W	YEL028W	462 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	NME1	NME1	340 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	PET111	YMR257C	2403 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	JJJ2	YJL162C	1752 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YGR045C	YGR045C	363 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YGR242W	YGR242W	309 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	NUT2	YPR168W	474 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	SPO77	YLR341W	1434 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	snR8	snR8	190 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	OCA6	YDR067C	675 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	VMA21	YGR105W	234 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	BIG1	YHR101C	1008 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	ISA2	YPR067W	558 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	BFA1	YJR053W	1725 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	RCO1	YMR075W	2055 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	AIM44	YPL158C	2277 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YLR101C	YLR101C	396 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	VPS52	YDR484W	1926 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YDR509W	YDR509W	348 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	INP2	YMR163C	2118 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	NPR2	YEL062W	1848 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YGR161W-A	YGR161W-A	1317 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YCL020W	YCL020W	1317 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	FYV4	YHR059W	393 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	CPR3	YML078W	549 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	MED11	YMR112C	396 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	SHE3	YBR130C	1278 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	MUB1	YMR100W	1863 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
DDR2	P89113	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	YGL138C	YGL138C	1038 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	CUL3	YGR003W	2235 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	RRT16	YNL105W	429 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	MPT5	YGL178W	2580 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	GLG1	YKR058W	1851 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	ISD11	YER048W-A	285 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	DPB11	YJL090C	2295 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	FUS2	YMR232W	2034 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	PXA2	YKL188C	2562 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	SMD1	YGR074W	441 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	YOR282W	YOR282W	321 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	STO1	YMR125W	2586 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	NNF2	YGR089W	2811 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	COG7	YGL005C	840 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	HOT13	YKL084W	351 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	YOR105W	YOR105W	327 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
DDR2	P89113	YOR169C	YOR169C	465 nt		-0.84	□□□□□ -2.54

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