Protein–RNA interactions for Protein: P38799

YHR078W, Uncharacterized protein YHR078W, yeastyeast

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR078WP38799 VPS35YJL154C 2835 nt2.74□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 NUM1YDR150W 8247 nt2.74□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 PAN3YKL025C 2040 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 TCB2YNL087W 3537 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 ISD11YER048W-A 285 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 PNC1YGL037C 651 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 RPL38YLR325C 237 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 HHT1YBR010W 411 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 IES4YOR189W 351 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 YPL216WYPL216W 3309 nt2.73□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 CYR1YJL005W 6081 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 NPC2YDL046W 522 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 RPA34YJL148W 702 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 TOF2YKR010C 2316 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 YPR063CYPR063C 423 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 SNU114YKL173W 3027 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 PRP6YBR055C 2700 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 SAP1YER047C 2694 nt2.72□□□□□ -1.97
YHR078WP38799 SGS1YMR190C 4344 nt2.71□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 HRD3YLR207W 2502 nt2.71□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 Q0092Q0092 141 nt2.71□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 PRE4YFR050C 801 nt2.71□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.71□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 GUP1YGL084C 1683 nt2.71□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 ALK2YBL009W 2031 nt2.71□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 FKS3YMR306W 5358 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 snR55snR55 98 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YJL182CYJL182C 318 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 RPL20AYMR242C 519 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 FPR1YNL135C 345 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 SNC2YOR327C 348 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 BFA1YJR053W 1725 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 TRA1YHR099W 11235 nt2.7□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 SOK2YMR016C 2358 nt2.69□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 TMN3YER113C 2121 nt2.69□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 HDA3YPR179C 1968 nt2.69□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 VMA9YCL005W-A 222 nt2.69□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 FLO11YIR019C 4104 nt2.69□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 RRP12YPL012W 3687 nt2.69□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 NPR2YEL062W 1848 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 snR60snR60 104 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 SMD1YGR074W 441 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 RPS22AYJL190C 393 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 PCC1YKR095W-A 267 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 IKI3YLR384C 4050 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 DUG2YBR281C 2637 nt2.68□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 RGA2YDR379W 3030 nt2.67□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 PDR3YBL005W 2931 nt2.67□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.67□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 NUT2YPR168W 474 nt2.67□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 snR43snR43 209 nt2.67□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 SCW11YGL028C 1629 nt2.67□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YGR250CYGR250C 2346 nt2.67□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YPL150WYPL150W 2706 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 FIR1YER032W 2631 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YLR278CYLR278C 4026 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 FMP16YDR070C 282 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 NOP10YHR072W-A 177 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 PFD1YJL179W 330 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 CYB5YNL111C 363 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 MVP1YMR004W 1536 nt2.66□□□□□ -1.98
YHR078WP38799 GPG1YGL121C 381 nt2.65□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YIL174WYIL174W 228 nt2.65□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.65□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 MSB2YGR014W 3921 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 SDC25YLL016W 3147 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 PEX8YGR077C 1770 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 NEW1YPL226W 3591 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YDR426CYDR426C 378 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YGR151CYGR151C 336 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YOL160WYOL160W 342 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YOR333CYOR333C 417 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YBR224WYBR224W 516 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 GCV2YMR189W 3105 nt2.64□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YBT1YLL048C 4986 nt2.63□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 MDM20YOL076W 2391 nt2.63□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 UPS1YLR193C 528 nt2.63□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YIL080WYIL080W 4722 nt2.63□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 PAU2YEL049W 363 nt2.62□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YLR255CYLR255C 354 nt2.62□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.62□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YOR302WYOR302W 78 nt2.62□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 LCL1YPL056C 306 nt2.62□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 PFF1YBR074W 2931 nt2.62□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 MMS1YPR164W 4224 nt2.61□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 TRX1YLR043C 312 nt2.61□□□□□ -1.99
YHR078WP38799 YNL028WYNL028W 318 nt2.61□□□□□ -1.99
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