Protein–RNA interactions for Protein: P32487

LYP1, Lysine-specific permease, yeast

Predictions only

Length 611 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYP1	P32487	PAM16	YJL104W	450 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	CYB5	YNL111C	363 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	IES4	YOR189W	351 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	SMY1	YKL079W	1971 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	INP53	YOR109W	3324 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.89	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	UPS1	YLR193C	528 nt		2.89	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YMR230W-A	YMR230W-A	189 nt		2.89	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	VPH1	YOR270C	2523 nt		2.89	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	PEP3	YLR148W	2757 nt		2.89	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	EFR3	YMR212C	2349 nt		2.88	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	MVP1	YMR004W	1536 nt		2.88	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YLR149C	YLR149C	2193 nt		2.88	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	ISD11	YER048W-A	285 nt		2.88	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		2.88	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	RPS12	YOR369C	432 nt		2.88	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.87	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	AFI1	YOR129C	2682 nt		2.87	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YLR255C	YLR255C	354 nt		2.87	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	DYN1	YKR054C	12279 nt		2.87	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	CDC27	YBL084C	2277 nt		2.87	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.87	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	SNF5	YBR289W	2718 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	PRP8	YHR165C	7242 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	CRM1	YGR218W	3255 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	VPS34	YLR240W	2628 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	CHS2	YBR038W	2892 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	TRX1	YLR043C	312 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	COX14	YML129C	213 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	SPO22	YIL073C	2928 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	RRP6	YOR001W	2202 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	INP51	YIL002C	2841 nt		2.86	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	SLH1	YGR271W	5904 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	MMS22	YLR320W	4365 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	NPR2	YEL062W	1848 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	GPG1	YGL121C	381 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	SNC1	YAL030W	354 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	NOP53	YPL146C	1368 nt		2.85	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YIL080W	YIL080W	4722 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YJL182C	YJL182C	318 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	EMC6	YLL014W	327 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YNL028W	YNL028W	318 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	MDM20	YOL076W	2391 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	GRR1	YJR090C	3456 nt		2.84	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	CBF2	YGR140W	2871 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	NAB6	YML117W	3405 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YGR050C	YGR050C	357 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	SCH9	YHR205W	2475 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	CFT2	YLR115W	2580 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	HOS4	YIL112W	3252 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	LCD1	YDR499W	2244 nt		2.83	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	STB4	YMR019W	2850 nt		2.82	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	PXA2	YKL188C	2562 nt		2.82	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		2.82	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	NMD2	YHR077C	3270 nt		2.82	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.82	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	RSE1	YML049C	4086 nt		2.82	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.82	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	PAU2	YEL049W	363 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	ERP6	YGL002W	651 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	CSE2	YNR010W	450 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	HSC82	YMR186W	2118 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	COS111	YBR203W	2775 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.81	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	MNL2	YLR057W	2550 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	UBP14	YBR058C	2346 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YGL052W	YGL052W	306 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	PFD1	YJL179W	330 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YNL114C	YNL114C	372 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	AMS1	YGL156W	3252 nt		2.8	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	POL3	YDL102W	3294 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	RPL42B	YHR141C	321 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	RPL6A	YML073C	531 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	RPL42A	YNL162W	321 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YBL083C	YBL083C	426 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	SSQ1	YLR369W	1974 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	GIS1	YDR096W	2685 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	FLO5	YHR211W	3228 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	CDC53	YDL132W	2448 nt		2.79	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	IRR1	YIL026C	3453 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	PLC1	YPL268W	2610 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YME2	YMR302C	2553 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	MUK1	YPL070W	1839 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	ESL1	YIL151C	3357 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	YOR302W	YOR302W	78 nt		2.78	□□□□□ -1.96
LYP1	P32487	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.78	□□□□□ -1.97
LYP1	P32487	HEH2	YDR458C	1992 nt		2.78	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 153.5 ms