Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEFLP07196 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEFLP07196 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEFLP07196 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFLP07196 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFLP07196 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFLP07196 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFLP07196 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFLP07196 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFLP07196 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms