Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms