Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR88Q6ZMY6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms