Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ODF4Q2M2E3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms