Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 AHC2YCR082W 387 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 NSE4YDL105W 1209 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 SNA4YDL123W 423 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 RGI1YER067W 486 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YIP1YGR172C 747 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YNL226WYNL226W 411 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 SNC2YOR327C 348 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 NCA2YPR155C 1851 nt0.69□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YDL157CYDL157C 357 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 RPL40AYIL148W 387 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 ATX1YNL259C 222 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YNR021WYNR021W 1215 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 CSI2YOL007C 1026 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 SUT2YPR009W 807 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YPR063CYPR063C 423 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 AEP1YMR064W 1557 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 NUP188YML103C 4968 nt0.68□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 MSC6YOR354C 2079 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YDR199WYDR199W 366 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 GIC2YDR309C 1152 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 HSK3YKL138C-A 210 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 IRC19YLL033W 693 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 COF1YLL050C 432 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YKE2YLR200W 345 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 RRT16YNL105W 429 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 CUR1YPR158W 759 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 SLK19YOR195W 2466 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 MGR1YCL044C 1254 nt0.67□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YGR250CYGR250C 2346 nt0.66□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 FUS2YMR232W 2034 nt0.66□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 DAS1YJL149W 1992 nt0.66□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 MUK1YPL070W 1839 nt0.66□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.66□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 RAM2YKL019W 951 nt0.66□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 NSL1YPL233W 651 nt0.66□□□□□ -2.3
YPK9Q12697 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.65□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 COG7YGL005C 840 nt0.65□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 YJL114WYJL114W 681 nt0.65□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 YLL054CYLL054C 2532 nt0.65□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 PRS3YHL011C 963 nt0.64□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 YBR032WYBR032W 303 nt0.64□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 TIF11YMR260C 462 nt0.63□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 SPP381YBR152W 876 nt0.63□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 YDR290WYDR290W 330 nt0.62□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 DUO1YGL061C 744 nt0.62□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 COX6YHR051W 447 nt0.62□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.62□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 YLR458WYLR458W 381 nt0.62□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 FAR3YMR052W 615 nt0.62□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 SAS3YBL052C 2496 nt0.62□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 YKL115CYKL115C 393 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 ERV15YBR210W 429 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 AZF1YOR113W 2745 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 NUR1YDL089W 1455 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 MEI4YER044C-A 1227 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 SDL1YIL167W 633 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 HYR1YIR037W 492 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 GRX8YLR364W 330 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 ATP18YML081C-A 180 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 RPS10BYMR230W 318 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 TRS20YBR254C 528 nt0.61□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 STB6YKL072W 2301 nt0.6□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 SWM2YNR004W 441 nt0.6□□□□□ -2.31
YPK9Q12697 RPL9AYGL147C 576 nt0.59□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 SPC1YJR010C-A 285 nt0.59□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 VPS25YJR102C 609 nt0.59□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.59□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 AME1YBR211C 975 nt0.59□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 CDC5YMR001C 2118 nt0.59□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 snR57snR57 88 nt0.58□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 GOS1YHL031C 672 nt0.58□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 RLM1YPL089C 2031 nt0.57□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 MAM1YER106W 909 nt0.57□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 RFA3YJL173C 369 nt0.57□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 RPL40BYKR094C 387 nt0.57□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.57□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 WAR1YML076C 2835 nt0.57□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 TMA20YER007C-A 546 nt0.56□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YJL032WYJL032W 315 nt0.56□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YBP2YGL060W 1926 nt0.56□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 SEC8YPR055W 3198 nt0.56□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 KEG1YFR042W 603 nt0.55□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 ABM1YJR108W 372 nt0.55□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 TAP42YMR028W 1101 nt0.55□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YNL179CYNL179C 438 nt0.55□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YBR063CYBR063C 1215 nt0.55□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 SMY1YKL079W 1971 nt0.55□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 ESA1YOR244W 1338 nt0.55□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 RTR1YER139C 681 nt0.54□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 GIC1YHR061C 945 nt0.54□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 EMC5YIL027C 426 nt0.54□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.54□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 FYV6YNL133C 522 nt0.54□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 BRX1YOL077C 876 nt0.54□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YAP3YHL009C 993 nt0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47 ms