Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 AHC2YCR082W 387 nt0.44□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt0.44□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 NOP10YHR072W-A 177 nt0.44□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 MIX23YBL107C 591 nt0.44□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YCR090CYCR090C 549 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YPD1YDL235C 504 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YIP1YGR172C 747 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YHR212CYHR212C 336 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YAR060CYAR060C 336 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YLR311CYLR311C 348 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 DAS1YJL149W 1992 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 MYO1YHR023W 5787 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 WAR1YML076C 2835 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 RPI1YIL119C 1224 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YLR225CYLR225C 1224 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 BFA1YJR053W 1725 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 CDC27YBL084C 2277 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YGR219WYGR219W 342 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 NUP188YML103C 4968 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YDL157CYDL157C 357 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 MSC6YOR354C 2079 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 LYS14YDR034C 2373 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 NUP120YKL057C 3114 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 HYR1YIR037W 492 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YMR178WYMR178W 825 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 GRX7YBR014C 612 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 ECM25YJL201W 1800 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 COF1YLL050C 432 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 RPL38YLR325C 237 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 STB6YKL072W 2301 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 GIC1YHR061C 945 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 FYV6YNL133C 522 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 FMP23YBR047W 528 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YLL007CYLL007C 1998 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 NUT1YGL151W 3399 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 SMY1YKL079W 1971 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 FAR7YFR008W 666 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YLR458WYLR458W 381 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 SLU7YDR088C 1149 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 AIM9YER080W 1884 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 PRS3YHL011C 963 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 RPL40BYKR094C 387 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YNL226WYNL226W 411 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YOR376WYOR376W 369 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 AME1YBR211C 975 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 snR45snR45 172 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YJL049WYJL049W 1353 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 TSA2YDR453C 591 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 PRM8YGL053W 714 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 SVP26YHR181W 687 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 ATX1YNL259C 222 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 YLL054CYLL054C 2532 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 MEI4YER044C-A 1227 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 EDC1YGL222C 528 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 ABM1YJR108W 372 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 RAD10YML095C 633 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 TIF11YMR260C 462 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 TRS20YBR254C 528 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 SNA4YDL123W 423 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 SMB1YER029C 591 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 MFA2YNL145W 117 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 IRC14YOR135C 342 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BLQ12490 AI5_BETAQ0075 1065 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 GIC2YDR309C 1152 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 HSK3YKL138C-A 210 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 SEC22YLR268W 645 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 SLX4YLR135W 2247 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YDR248CYDR248C 582 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 COX6YHR051W 447 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 TAP42YMR028W 1101 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 SWS2YNL081C 432 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 ARP9YMR033W 1404 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 ECM12YHR021W-A 456 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 SDL1YIL167W 633 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 MUM2YBR057C 1101 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.31□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 GDS1YOR355W 1569 nt0.31□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 AEP1YMR064W 1557 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 VAB2YEL005C 849 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 TMA20YER007C-A 546 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 LAG1YHL003C 1236 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 EMC5YIL027C 426 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 VPS25YJR102C 609 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 IRC19YLL033W 693 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 POP8YBL018C 402 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YET2YMR040W 483 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 IRC23YOR044W 474 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 ICS2YBR157C 768 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 SWT1YOR166C 1377 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 COG7YGL005C 840 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 RPL9AYGL147C 576 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.29□□□□□ -2.36
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