Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 NOT5YPR072W 1683 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YLR149CYLR149C 2193 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 RPL9AYGL147C 576 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 APQ13YJL075C 417 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 PKR1YMR123W 369 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 COX7YMR256C 183 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YBL108WYBL108W 306 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 SPC29YPL124W 762 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 IRC16YPR038W 360 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 GYP5YPL249C 2685 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 VPS15YBR097W 4365 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 NUP120YKL057C 3114 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YAP3YHL009C 993 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YPL238CYPL238C 390 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 ARP7YPR034W 1434 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 SWT1YOR166C 1377 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 MYO4YAL029C 4416 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 BTT1YDR252W 450 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 NOP15YNL110C 663 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 PLC1YPL268W 2610 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 SLM1YIL105C 2061 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 SMY1YKL079W 1971 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 SNF5YBR289W 2718 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 PUT3YKL015W 2940 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 snR79snR79 84 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 CTK3YML112W 891 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YOR093CYOR093C 4947 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 MSS11YMR164C 2277 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YDL118WYDL118W 381 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YDR250CYDR250C 276 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 HSH155YMR288W 2916 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 AGC1YPR021C 2709 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 SEC63YOR254C 1992 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 ZRG8YER033C 3231 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 NEO1YIL048W 3456 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 PPN1YDR452W 2025 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YOR248WYOR248W 303 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 YBR224WYBR224W 516 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN5Q12250 DAS1YJL149W 1992 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 PEP3YLR148W 2757 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YER121WYER121W 345 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 COX13YGL191W 390 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 BIG1YHR101C 1008 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YBL083CYBL083C 426 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 LYS9YNR050C 1341 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 SHE9YDR393W 1371 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 SEY1YOR165W 2331 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 RBK1YCR036W 1002 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YCR043CYCR043C 384 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YGL024WYGL024W 336 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YJR039WYJR039W 3366 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 LRE1YCL051W 1752 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 DAD4YDR320C-A 219 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 RPL16AYIL133C 600 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 PBI2YNL015W 228 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 GPI15YNL038W 690 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 DIS3YOL021C 3006 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 MYO2YOR326W 4725 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 SEC31YDL195W 3822 nt1.81□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 TDA9YML081W 3756 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 DFG16YOR030W 1860 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 PAU3YCR104W 375 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YAR068WYAR068W 486 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 RPS18BYML026C 441 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 TIF11YMR260C 462 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YPR039WYPR039W 336 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YBR184WYBR184W 1572 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 RNH70YGR276C 1662 nt1.8□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 MSH6YDR097C 3729 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 CDC24YAL041W 2565 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 MXR1YER042W 555 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YHR210CYHR210C 1026 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 FCF2YLR051C 654 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YOR392WYOR392W 444 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 HSL1YKL101W 4557 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 SSQ1YLR369W 1974 nt1.79□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 PEP1YBL017C 4740 nt1.78□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YNL144CYNL144C 2223 nt1.78□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YJR098CYJR098C 1971 nt1.78□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 ATP17YDR377W 306 nt1.78□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 MTC7YEL033W 420 nt1.78□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.78□□□□□ -2.12
RPN5Q12250 IRE1YHR079C 3348 nt1.78□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 TFC8YPL007C 1767 nt1.77□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YHR130CYHR130C 336 nt1.77□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 DDR48YMR173W 1293 nt1.77□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 LOA1YPR139C 903 nt1.77□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YCL023CYCL023C 348 nt1.77□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 NOP53YPL146C 1368 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms