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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
RPS18B
YML026C
441 nt
1.98
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
YMR153C-A
YMR153C-A
336 nt
1.98
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
snR43
snR43
209 nt
1.98
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
IRC8
YJL051W
2469 nt
1.98
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
YMR045C
YMR045C
5268 nt
1.98
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
STB4
YMR019W
2850 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
VMR1
YHL035C
4779 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
NOP14
YDL148C
2433 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
YDR250C
YDR250C
276 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
RRF1
YHR038W
693 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
YJR157W
YJR157W
363 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
YLR222C-A
YLR222C-A
231 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
SMC6
YLR383W
3345 nt
1.97
□□□□□ -2.09
VAM3
Q12241
SAP185
YJL098W
3177 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
VPS8
YAL002W
3825 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YHR139C-A
YHR139C-A
312 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YKL063C
YKL063C
504 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
CMC2
YBL059C-A
330 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
RUF22
RUF22
515 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
CDC33
YOL139C
642 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YBR032W
YBR032W
303 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
EGD1
YPL037C
474 nt
1.96
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YGL024W
YGL024W
336 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
KOG1
YHR186C
4674 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
HSK3
YKL138C-A
210 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
FCF2
YLR051C
654 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
TIF11
YMR260C
462 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YNL324W
YNL324W
396 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YPR146C
YPR146C
330 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YDR341C
YDR341C
1824 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
NOT5
YPR072W
1683 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
GRR1
YJR090C
3456 nt
1.95
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
GDS1
YOR355W
1569 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
SET2
YJL168C
2202 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YLR149C
YLR149C
2193 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
RPL27B
YDR471W
411 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
VAR1
Q0140
1197 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YAL059C-A
YAL059C-A
423 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YLR264C-A
YLR264C-A
117 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YOR394C-A
YOR394C-A
168 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
SCP160
YJL080C
3669 nt
1.94
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
LYS9
YNR050C
1341 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
SIR4
YDR227W
4077 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
SYH1
YPL105C
2550 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YDL062W
YDL062W
426 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
RPL37B
YDR500C
267 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YBR224W
YBR224W
516 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
TFC3
YAL001C
3483 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
SCH9
YHR205W
2475 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
MNL2
YLR057W
2550 nt
1.93
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
CHC1
YGL206C
4962 nt
1.92
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
TMA22
YJR014W
597 nt
1.92
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
ZEO1
YOL109W
342 nt
1.92
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
RPL36B
YPL249C-A
303 nt
1.92
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
VTC3
YPL019C
2508 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
UBR2
YLR024C
5619 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
RBK1
YCR036W
1002 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YER135C
YER135C
393 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YJL052C-A
YJL052C-A
120 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
NFU1
YKL040C
771 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
PSY1
YKL076C
384 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
YLR406C-A
YLR406C-A
150 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
UBP1
YDL122W
2430 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
PEP3
YLR148W
2757 nt
1.91
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
NAM7
YMR080C
2916 nt
1.9
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
SMY1
YKL079W
1971 nt
1.9
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
VPS41
YDR080W
2979 nt
1.9
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
BUD2
YKL092C
3315 nt
1.9
□□□□□ -2.1
VAM3
Q12241
SPP41
YDR464W
4308 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YHR071C-A
YHR071C-A
321 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YML084W
YML084W
309 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YBL083C
YBL083C
426 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
ERP4
YOR016C
624 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
MSS18
YPR134W
807 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
CAT2
YML042W
2013 nt
1.9
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
PET309
YLR067C
2898 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YPP1
YGR198W
2454 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
FKS1
YLR342W
5631 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
BRE1
YDL074C
2103 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
QCR7
YDR529C
384 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YGR042W
YGR042W
816 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
CRG1
YHR209W
876 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
URM1
YIL008W
300 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
PAU14
YIL176C
363 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
PAU1
YJL223C
363 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
CYB5
YNL111C
363 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
PGA1
YNL158W
597 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
PRM3
YPL192C
402 nt
1.89
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
RPH1
YER169W
2391 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
GCN2
YDR283C
4980 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
SLM1
YIL105C
2061 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YCR087C-A
YCR087C-A
462 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YER023C-A
YER023C-A
213 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YBR121C-A
YBR121C-A
159 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
APL5
YPL195W
2799 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
HER1
YOR227W
3741 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
SNF5
YBR289W
2718 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YFR016C
YFR016C
3702 nt
1.88
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
NAB6
YML117W
3405 nt
1.87
□□□□□ -2.11
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