Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 RPL20AYMR242C 519 nt3.19□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YNL198CYNL198C 303 nt3.19□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 COG8YML071C 1824 nt3.19□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 SHQ1YIL104C 1524 nt3.19□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 HCS1YKL017C 2052 nt3.18□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YMR317WYMR317W 3423 nt3.18□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YHL042WYHL042W 453 nt3.18□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 FPR1YNL135C 345 nt3.18□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 SNT1YCR033W 3681 nt3.18□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 PRP6YBR055C 2700 nt3.18□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 RIM20YOR275C 1986 nt3.18□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 HRD3YLR207W 2502 nt3.17□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt3.17□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 PAN3YKL025C 2040 nt3.17□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YCK3YER123W 1575 nt3.17□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 DFG16YOR030W 1860 nt3.16□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YBL065WYBL065W 345 nt3.16□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 RRM3YHR031C 2172 nt3.16□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YML037CYML037C 1023 nt3.15□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 GOT1YMR292W 417 nt3.15□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YBR064WYBR064W 429 nt3.15□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 TOF2YKR010C 2316 nt3.15□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 CSR2YPR030W 3366 nt3.15□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 RRP12YPL012W 3687 nt3.15□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 SPO14YKR031C 5052 nt3.15□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 SNU114YKL173W 3027 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 DYN1YKR054C 12279 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 DUG2YBR281C 2637 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 BFA1YJR053W 1725 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 SMD1YGR074W 441 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 APQ12YIL040W 417 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 RPL38YLR325C 237 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 HHT1YBR010W 411 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 SNC2YOR327C 348 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 snR42snR42 351 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 SIN3YOL004W 4611 nt3.14□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 DBP7YKR024C 2229 nt3.13□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 NPC2YDL046W 522 nt3.13□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 PRE4YFR050C 801 nt3.13□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 GUP1YGL084C 1683 nt3.13□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YTA7YGR270W 4140 nt3.13□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YLL032CYLL032C 2478 nt3.13□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 RGA2YDR379W 3030 nt3.12□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 FIR1YER032W 2631 nt3.12□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YPR063CYPR063C 423 nt3.12□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 ALK2YBL009W 2031 nt3.12□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 IKI3YLR384C 4050 nt3.12□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 MET6YER091C 2304 nt3.11□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 TMN3YER113C 2121 nt3.11□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 FMP16YDR070C 282 nt3.11□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 NOP10YHR072W-A 177 nt3.11□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 DRS2YAL026C 4068 nt3.11□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 SDC25YLL016W 3147 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 PAM16YJL104W 450 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 VMA9YCL005W-A 222 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YCL023CYCL023C 348 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 TAO3YIL129C 7131 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 HDA3YPR179C 1968 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 GCV2YMR189W 3105 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YBT1YLL048C 4986 nt3.1□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 YOR296WYOR296W 3870 nt3.09□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.09□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.09□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 RPA34YJL148W 702 nt3.09□□□□□ -1.91
MCD1Q12158 SOK2YMR016C 2358 nt3.09□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 POL2YNL262W 6669 nt3.09□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 APC9YLR102C 798 nt3.08□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 IES4YOR189W 351 nt3.08□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 NUT2YPR168W 474 nt3.08□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 MDM1YML104C 3384 nt3.08□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 DBP10YDL031W 2988 nt3.07□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 snR60snR60 104 nt3.07□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 PCC1YKR095W-A 267 nt3.07□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 YML007C-AYML007C-A 111 nt3.07□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 ECM21YBL101C 3354 nt3.07□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 CIN8YEL061C 3003 nt3.06□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 MMS1YPR164W 4224 nt3.06□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 RIF1YBR275C 5751 nt3.06□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 snR55snR55 98 nt3.06□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 CRS5YOR031W 210 nt3.06□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 CHS2YBR038W 2892 nt3.06□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 VPS16YPL045W 2397 nt3.05□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 PEX8YGR077C 1770 nt3.05□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 ISD11YER048W-A 285 nt3.05□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 PHD1YKL043W 1101 nt3.05□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 YOR333CYOR333C 417 nt3.05□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 YGR250CYGR250C 2346 nt3.05□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 SCW11YGL028C 1629 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 MVP1YMR004W 1536 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 DYN2YDR424C 279 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 ACB1YGR037C 264 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 CYB5YNL111C 363 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 YBR224WYBR224W 516 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 TAE2YPL009C 3117 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 NPR2YEL062W 1848 nt3.04□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 SEF1YBL066C 3447 nt3.03□□□□□ -1.92
MCD1Q12158 YDR426CYDR426C 378 nt3.03□□□□□ -1.92
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