Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 YGR130CYGR130C 2451 nt1.28□□□□□ -2.2
TRM12Q04235 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1.27□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 RPL37AYLR185W 267 nt1.27□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 PLC1YPL268W 2610 nt1.27□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 MNL2YLR057W 2550 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 FRK1YPL141C 2598 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 IRE1YHR079C 3348 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 TMA20YER007C-A 546 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 VOA1YGR106C 798 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YJL119CYJL119C 324 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 BUD19YJL188C 309 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 URA10YMR271C 684 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 RNR4YGR180C 1038 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YHR054CYHR054C 1065 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 CMC2YBL059C-A 330 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 ROX1YPR065W 1107 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 SKI3YPR189W 4299 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 ZRG8YER033C 3231 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 IML1YJR138W 4755 nt1.24□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YDL068WYDL068W 330 nt1.24□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YLR140WYLR140W 327 nt1.24□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 RPS7BYNL096C 573 nt1.24□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 MAD1YGL086W 2250 nt1.24□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 NOP53YPL146C 1368 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YGR228WYGR228W 345 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 RTC6YPL183W-A 282 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YBR063CYBR063C 1215 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 GPX2YBR244W 489 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 HIR3YJR140C 4947 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 YSW1YBR148W 1830 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 CTR9YOL145C 3234 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 NOT5YPR072W 1683 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 snR9snR9 187 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 MND1YGL183C 660 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 TIM8YJR135W-A 264 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 CMS1YLR003C 876 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 GRX5YPL059W 453 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 NUP82YJL061W 2142 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 MDM32YOR147W 1869 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 PIP2YOR363C 2991 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 SNF5YBR289W 2718 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM12Q04235 SEC21YNL287W 2808 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 BI4Q0120 1917 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 PBY1YBR094W 2262 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 RTR2YDR066C 591 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 SPO11YHL022C 1197 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 PKR1YMR123W 369 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 PGA1YNL158W 597 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 RPL33BYOR234C 324 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YPR172WYPR172W 603 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 COX1Q0045 1605 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 ASM4YDL088C 1587 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 DAS1YJL149W 1992 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 ECM9YKR004C 1134 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 SEC22YLR268W 645 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YML003WYML003W 873 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YMR254CYMR254C 309 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YBL083CYBL083C 426 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 CSM4YPL200W 471 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YGL015CYGL015C 393 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YGR250CYGR250C 2346 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 Q0255Q0255 1419 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 MCM22YJR135C 720 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 SPO75YLL005C 2607 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 SGD1YLR336C 2700 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 BST1YFL025C 3090 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YLR149CYLR149C 2193 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 NUP120YKL057C 3114 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 SMY1YKL079W 1971 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 TRM732YMR259C 4263 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 CDC36YDL165W 576 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 LSO2YGR169C-A 279 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 TIF11YMR260C 462 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YMR324CYMR324C 243 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YPR096CYPR096C 303 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YBR224WYBR224W 516 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 KAR3YPR141C 2190 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 RTT102YGR275W 474 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 ATP20YPR020W 348 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 PEP3YLR148W 2757 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YCR043CYCR043C 384 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 IES5YER092W 378 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YER121WYER121W 345 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YAR068WYAR068W 486 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 YOL029CYOL029C 606 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 EGD1YPL037C 474 nt1.16□□□□□ -2.22
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