Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB1P53618 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPB1P53618 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPB1P53618 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPB1P53618 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB1P53618 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB1P53618 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB1P53618 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB1P53618 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB1P53618 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB1P53618 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB1P53618 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB1P53618 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms