Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 SEN15YMR059W 387 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YBL108WYBL108W 306 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 FYV12YOR183W 390 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 CRM1YGR218W 3255 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 UBP2YOR124C 3819 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 NUP82YJL061W 2142 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 VTC3YPL019C 2508 nt2.05□□□□□ -2.08
MDE1P47095 NAM7YMR080C 2916 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 HMRA1YCR097W 381 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 CAJ1YER048C 1176 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YER135CYER135C 393 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 AYR1YIL124W 894 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 PAU14YIL176C 363 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 PAU1YJL223C 363 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 SOK2YMR016C 2358 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 TSC3YBR058C-A 243 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 SLM6YBR266C 453 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 APL5YPL195W 2799 nt2.04□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YDR341CYDR341C 1824 nt2.03□□□□□ -2.08
MDE1P47095 KOG1YHR186C 4674 nt2.03□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.03□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YGR025WYGR025W 303 nt2.03□□□□□ -2.08
MDE1P47095 COX7YMR256C 183 nt2.03□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YPR039WYPR039W 336 nt2.03□□□□□ -2.08
MDE1P47095 SEC31YDL195W 3822 nt2.03□□□□□ -2.08
MDE1P47095 YDL068WYDL068W 330 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 ATP6Q0085 780 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YLR053CYLR053C 327 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YBR032WYBR032W 303 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 LEE1YPL054W 906 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 BRE1YDL074C 2103 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 SYH1YPL105C 2550 nt2.02□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.01□□□□□ -2.09
MDE1P47095 RPL37BYDR500C 267 nt2.01□□□□□ -2.09
MDE1P47095 DGR1YNL130C-A 147 nt2.01□□□□□ -2.09
MDE1P47095 LSM7YNL147W 348 nt2.01□□□□□ -2.09
MDE1P47095 snR13snR13 124 nt2.01□□□□□ -2.09
MDE1P47095 TFC3YAL001C 3483 nt2.01□□□□□ -2.09
MDE1P47095 MYO2YOR326W 4725 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YJL016WYJL016W 1686 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 NAN1YPL126W 2691 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 CFT2YLR115W 2580 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 VPS52YDR484W 1926 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 STB4YMR019W 2850 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YAR068WYAR068W 486 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 UTP22YGR090W 3714 nt2□□□□□ -2.09
MDE1P47095 SPO23YBR250W 1572 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YDR157WYDR157W 402 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YEL057CYEL057C 702 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YER079WYER079W 633 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YNL010WYNL010W 726 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 EGD1YPL037C 474 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 UBP1YDL122W 2430 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 RPH1YER169W 2391 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 UFD4YKL010C 4452 nt1.99□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YDL041WYDL041W 354 nt1.98□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.98□□□□□ -2.09
MDE1P47095 IES5YER092W 378 nt1.98□□□□□ -2.09
MDE1P47095 RPS22BYLR367W 393 nt1.98□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YMR324CYMR324C 243 nt1.98□□□□□ -2.09
MDE1P47095 PUT3YKL015W 2940 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 HSH155YMR288W 2916 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 BTT1YDR252W 450 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YDR286CYDR286C 345 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 ATP17YDR377W 306 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 ROX1YPR065W 1107 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 IRC10YOL015W 1761 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YFR016CYFR016C 3702 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 SWT1YOR166C 1377 nt1.97□□□□□ -2.09
MDE1P47095 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 YDR269CYDR269C 324 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 GCN4YEL009C 846 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 NFU1YKL040C 771 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 PSY1YKL076C 384 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 ZEO1YOL109W 342 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 YOL159CYOL159C 516 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 FAB1YFR019W 6837 nt1.96□□□□□ -2.1
MDE1P47095 BFA1YJR053W 1725 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 MZM1YDR493W 372 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 VOA1YGR106C 798 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 NOP10YHR072W-A 177 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 YHR138CYHR138C 345 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 GRX8YLR364W 330 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 RIC1YLR039C 3171 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 TDA9YML081W 3756 nt1.95□□□□□ -2.1
MDE1P47095 snR56snR56 88 nt1.94□□□□□ -2.1
MDE1P47095 snR79snR79 84 nt1.94□□□□□ -2.1
MDE1P47095 SWF1YDR126W 1011 nt1.94□□□□□ -2.1
MDE1P47095 VTC1YER072W 390 nt1.94□□□□□ -2.1
MDE1P47095 BRP1YGL007W 378 nt1.94□□□□□ -2.1
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