Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	SPC29	YPL124W	762 nt		1.65	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	IRC16	YPR038W	360 nt		1.65	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	SPE1	YKL184W	1401 nt		1.65	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	STB4	YMR019W	2850 nt		1.65	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	LRE1	YCL051W	1752 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	MSH3	YCR092C	3057 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	IRC4	YDR540C	540 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YHR073W-A	YHR073W-A	177 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	PEP8	YJL053W	1140 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YPR177C	YPR177C	372 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	SEY1	YOR165W	2331 nt		1.64	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	BFA1	YJR053W	1725 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	DPB11	YJL090C	2295 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	CHZ1	YER030W	462 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YER038W-A	YER038W-A	381 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	RPL9A	YGL147C	576 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	SPO13	YHR014W	876 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	ATP15	YPL271W	189 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	UTP21	YLR409C	2820 nt		1.63	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YCR001W	YCR001W	315 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YDR286C	YDR286C	345 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YGL015C	YGL015C	393 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	COX13	YGL191W	390 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YIL030W-A	YIL030W-A	339 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	CDC31	YOR257W	486 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	RIC1	YLR039C	3171 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	RPH1	YER169W	2391 nt		1.62	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	DOT6	YER088C	2013 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	SMD1	YGR074W	441 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YHR210C	YHR210C	1026 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YJL127C-B	YJL127C-B	159 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	CMS1	YLR003C	876 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	RPL37A	YLR185W	267 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	GRX8	YLR364W	330 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	CTK3	YML112W	891 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	BI4	Q0120	1917 nt		1.61	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	CFT2	YLR115W	2580 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YCR087C-A	YCR087C-A	462 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	MET32	YDR253C	576 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	HOP2	YGL033W	657 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YHR139C-A	YHR139C-A	312 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	AIM29	YKR074W	468 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	AFB1	YLR040C	675 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	PKR1	YMR123W	369 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	SVS1	YPL163C	783 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	snR41	snR41	95 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	PMD1	YER132C	5262 nt		1.6	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YDR194W-A	YDR194W-A	153 nt		1.59	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YAP3	YHL009C	993 nt		1.59	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	RRT1	YBL048W	312 nt		1.59	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	URA10	YMR271C	684 nt		1.59	□□□□□ -2.15
ATG12	P38316	YLR422W	YLR422W	5799 nt		1.59	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	MUD2	YKL074C	1584 nt		1.59	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YDL062W	YDL062W	426 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	BNA7	YDR428C	786 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YLR031W	YLR031W	561 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	SYM1	YLR251W	594 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	PBI2	YNL015W	228 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	RPS7B	YNL096C	573 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	CDC33	YOL139C	642 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	ASM4	YDL088C	1587 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	MDM32	YOR147W	1869 nt		1.58	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	SPR3	YGR059W	1539 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	DFG16	YOR030W	1860 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	PAU3	YCR104W	375 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	HNT1	YDL125C	477 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	VOA1	YGR106C	798 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YIL102C	YIL102C	306 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	RPI1	YIL119C	1224 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	RPL16A	YIL133C	600 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YJR079W	YJR079W	330 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		1.57	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	SPO22	YIL073C	2928 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YCR102W-A	YCR102W-A	198 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YDL068W	YDL068W	330 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	CRG1	YHR209W	876 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YLR269C	YLR269C	351 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	TIF11	YMR260C	462 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	RPB11	YOL005C	363 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	SNC2	YOR327C	348 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YPL205C	YPL205C	345 nt		1.56	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	CDC27	YBL084C	2277 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	CHC1	YGL206C	4962 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	ATP17	YDR377W	306 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	BI2	Q0110	1272 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	CYB5	YNL111C	363 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	ROX1	YPR065W	1107 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	SEC63	YOR254C	1992 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	MDM20	YOL076W	2391 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	RNH70	YGR276C	1662 nt		1.55	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	TIM10	YHR005C-A	282 nt		1.54	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	PFD1	YJL179W	330 nt		1.54	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	TIM8	YJR135W-A	264 nt		1.54	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YPL238C	YPL238C	390 nt		1.54	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	PIP2	YOR363C	2991 nt		1.54	□□□□□ -2.16

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