Protein–RNA interactions for Protein: P35997

RPS27A, 40S ribosomal protein S27-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS27AP35997 snR13snR13 124 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YLL054CYLL054C 2532 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 SRB4YER022W 2064 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 THO2YNL139C 4794 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 STE5YDR103W 2754 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 BRO1YPL084W 2535 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YGL109WYGL109W 324 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YIL141WYIL141W 390 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 RPL40BYKR094C 387 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 CIN2YPL241C 807 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 snR68snR68 136 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YHR212CYHR212C 336 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 BMT5YIL096C 1011 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 RPI1YIL119C 1224 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 HSK3YKL138C-A 210 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 RCN1YKL159C 636 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YAR060CYAR060C 336 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 TIF11YMR260C 462 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YBL077WYBL077W 432 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 LDH1YBR204C 1128 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 MGR1YCL044C 1254 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 PKH2YOL100W 3246 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 YSP1YHR155W 3687 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 RMD5YDR255C 1266 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 RPL37AYLR185W 267 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 MRPL40YPL173W 894 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS27AP35997 NGG1YDR176W 2109 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 SLX4YLR135W 2247 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 SWF1YDR126W 1011 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 YGL217CYGL217C 342 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 ABM1YJR108W 372 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 snR35snR35 204 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 snR45snR45 172 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 BEM3YPL115C 3387 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 BFA1YJR053W 1725 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 MAM1YER106W 909 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 YLR225CYLR225C 1224 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 LTO1YNL260C 597 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 YPL034WYPL034W 498 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 NDD1YOR372C 1665 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 FUS2YMR232W 2034 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 TOF2YKR010C 2316 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 RSM28YDR494W 1086 nt0□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 SDL1YIL167W 633 nt0□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 VPS25YJR102C 609 nt0□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 SPT21YMR179W 2277 nt0□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 PGA1YNL158W 597 nt0□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 NOP12YOL041C 1380 nt0□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 PIG1YLR273C 1947 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 AFR1YDR085C 1863 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 CET1YPL228W 1650 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 SNA4YDL123W 423 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 ARL3YPL051W 597 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 AI3Q0060 1248 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 LAG1YHL003C 1236 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 CDC27YBL084C 2277 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 SMD1YGR074W 441 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 YMR324CYMR324C 243 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 ICS2YBR157C 768 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27AP35997 YDL196WYDL196W 330 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 DUO1YGL061C 744 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 SAY1YGR263C 1275 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 RPL9BYNL067W 576 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 MIX23YBL107C 591 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 TYE7YOR344C 876 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 LOA1YPR139C 903 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 SLM6YBR266C 453 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YDL206WYDL206W 2289 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 PRP39YML046W 1890 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 COX12YLR038C 252 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 FMP23YBR047W 528 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 MDM36YPR083W 1740 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 ECM25YJL201W 1800 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 RIF2YLR453C 1188 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YOL050CYOL050C 321 nt-0.07□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 MFA1YDR461W 111 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 ALG13YGL047W 609 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 SVP26YHR181W 687 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 HYM1YKL189W 1200 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 IES4YOR189W 351 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YPR170CYPR170C 336 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 NTC20YBR188C 423 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 VIK1YPL253C 1944 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 MLP2YIL149C 5040 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 RPC25YKL144C 639 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YIM2YMR151W 438 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 BRX1YOL077C 876 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YOR053WYOR053W 342 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YBR012CYBR012C 420 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS27AP35997 YMR099CYMR099C 894 nt-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.3 ms