Protein–RNA interactions for Protein: P15179

MSD1, Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSD1P15179 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 CRS5YOR031W 210 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 MSB2YGR014W 3921 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 FIR1YER032W 2631 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 SGD1YLR336C 2700 nt2.95□□□□□ -1.94
MSD1P15179 FRE2YKL220C 2136 nt2.93□□□□□ -1.94
MSD1P15179 MET6YER091C 2304 nt2.93□□□□□ -1.94
MSD1P15179 RPL35AYDL191W 363 nt2.93□□□□□ -1.94
MSD1P15179 RTC6YPL183W-A 282 nt2.93□□□□□ -1.94
MSD1P15179 snR51snR51 107 nt2.93□□□□□ -1.94
MSD1P15179 SSN2YDR443C 4263 nt2.93□□□□□ -1.94
MSD1P15179 REV3YPL167C 4515 nt2.92□□□□□ -1.94
MSD1P15179 SDC25YLL016W 3147 nt2.92□□□□□ -1.94
MSD1P15179 SPG3YDR504C 384 nt2.92□□□□□ -1.94
MSD1P15179 YJL015CYJL015C 285 nt2.92□□□□□ -1.94
MSD1P15179 RPL33AYPL143W 324 nt2.92□□□□□ -1.94
MSD1P15179 SNQ2YDR011W 4506 nt2.92□□□□□ -1.94
MSD1P15179 DOT6YER088C 2013 nt2.92□□□□□ -1.94
MSD1P15179 RSN1YMR266W 2862 nt2.91□□□□□ -1.94
MSD1P15179 RGA2YDR379W 3030 nt2.91□□□□□ -1.94
MSD1P15179 FMP16YDR070C 282 nt2.91□□□□□ -1.94
MSD1P15179 RPL32YBL092W 393 nt2.91□□□□□ -1.94
MSD1P15179 HRD3YLR207W 2502 nt2.91□□□□□ -1.94
MSD1P15179 SOK2YMR016C 2358 nt2.9□□□□□ -1.94
MSD1P15179 HTB2YBL002W 396 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YPR099CYPR099C 357 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 ESL1YIL151C 3357 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 FKS3YMR306W 5358 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 NEW1YPL226W 3591 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 PAC1YOR269W 1485 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 SNU114YKL173W 3027 nt2.9□□□□□ -1.95
MSD1P15179 RBK1YCR036W 1002 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 CSN9YDR179C 489 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YGR265WYGR265W 411 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 SNC2YOR327C 348 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 INP52YNL106C 3552 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YER138CYER138C 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YER160CYER160C 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YJR027WYJR027W 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YML039WYML039W 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YML045WYML045W 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YMR050CYMR050C 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.89□□□□□ -1.95
MSD1P15179 VPS35YJL154C 2835 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 HTL1YCR020W-B 237 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YIL059CYIL059C 366 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YOP1YPR028W 543 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 OSH6YKR003W 1347 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 MMS22YLR320W 4365 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 RAX2YLR084C 3663 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YDR186CYDR186C 2634 nt2.88□□□□□ -1.95
MSD1P15179 SLN1YIL147C 3663 nt2.87□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YGR067CYGR067C 2415 nt2.87□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YDR344CYDR344C 444 nt2.87□□□□□ -1.95
MSD1P15179 RPL36AYMR194W 303 nt2.87□□□□□ -1.95
MSD1P15179 VMA9YCL005W-A 222 nt2.87□□□□□ -1.95
MSD1P15179 DFG16YOR030W 1860 nt2.87□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YPL150WYPL150W 2706 nt2.86□□□□□ -1.95
MSD1P15179 TOF2YKR010C 2316 nt2.86□□□□□ -1.95
MSD1P15179 KAP123YER110C 3342 nt2.86□□□□□ -1.95
MSD1P15179 RPS22AYJL190C 393 nt2.86□□□□□ -1.95
MSD1P15179 FLO11YIR019C 4104 nt2.86□□□□□ -1.95
MSD1P15179 VPS16YPL045W 2397 nt2.86□□□□□ -1.95
MSD1P15179 STE11YLR362W 2154 nt2.85□□□□□ -1.95
MSD1P15179 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.85□□□□□ -1.95
MSD1P15179 RRP12YPL012W 3687 nt2.84□□□□□ -1.95
MSD1P15179 MRPL33YMR286W 261 nt2.84□□□□□ -1.95
MSD1P15179 PAN3YKL025C 2040 nt2.84□□□□□ -1.95
MSD1P15179 ALK2YBL009W 2031 nt2.84□□□□□ -1.95
MSD1P15179 BFA1YJR053W 1725 nt2.84□□□□□ -1.96
MSD1P15179 BPT1YLL015W 4680 nt2.84□□□□□ -1.96
MSD1P15179 INP53YOR109W 3324 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 YDR048CYDR048C 315 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 CYC7YEL039C 342 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 YGL069CYGL069C 465 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 SMD1YGR074W 441 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 PHS1YJL097W 654 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 RIM20YOR275C 1986 nt2.83□□□□□ -1.96
MSD1P15179 UBP1YDL122W 2430 nt2.82□□□□□ -1.96
MSD1P15179 MOT1YPL082C 5604 nt2.82□□□□□ -1.96
MSD1P15179 NFT1YKR103W 3657 nt2.82□□□□□ -1.96
MSD1P15179 PFF1YBR074W 2931 nt2.82□□□□□ -1.96
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