Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIRT1Q96EB6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms