Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms