Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms