Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIF1AQ16665 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms