Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 SNC1YAL030W 354 nt2.33□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 PHO2YDL106C 1680 nt2.33□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 PHO91YNR013C 2685 nt2.33□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YRB1YDR002W 606 nt2.32□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.32□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 TEN1YLR010C 483 nt2.32□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SMC6YLR383W 3345 nt2.32□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SAK1YER129W 3429 nt2.32□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 AFI1YOR129C 2682 nt2.32□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 VPS13YLL040C 9435 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 KAP123YER110C 3342 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YDL041WYDL041W 354 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 ATP17YDR377W 306 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 LSO2YGR169C-A 279 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YLR101CYLR101C 396 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 RPS17AYML024W 411 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 VTI1YMR197C 654 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YMR324CYMR324C 243 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 MSS11YMR164C 2277 nt2.31□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SCD5YOR329C 2619 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 snR79snR79 84 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YGR025WYGR025W 303 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SMD1YGR074W 441 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 PEX17YNL214W 600 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YNL324WYNL324W 396 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 snR13snR13 124 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 RTC6YPL183W-A 282 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 GDS1YOR355W 1569 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SNX41YDR425W 1878 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 STE11YLR362W 2154 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YPP1YGR198W 2454 nt2.3□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 MSB1YOR188W 3414 nt2.29□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YCR064CYCR064C 411 nt2.29□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.29□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 RSA1YPL193W 1146 nt2.29□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 CSF1YLR087C 8877 nt2.29□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SVL3YPL032C 2478 nt2.29□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 TMN3YER113C 2121 nt2.29□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SGS1YMR190C 4344 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YSW1YBR148W 1830 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 CLN3YAL040C 1743 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SPF1YEL031W 3648 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YGR042WYGR042W 816 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 MSL1YIR009W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YKL063CYKL063C 504 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 UTP30YKR060W 825 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 TIF11YMR260C 462 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 CDC33YOL139C 642 nt2.28□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 VPS41YDR080W 2979 nt2.28□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 NIC96YFR002W 2520 nt2.27□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 IRA2YOL081W 9240 nt2.27□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YFH1YDL120W 525 nt2.27□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 SEC22YLR268W 645 nt2.27□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 CMC2YBL059C-A 330 nt2.27□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 KAR3YPR141C 2190 nt2.27□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 MRP10YDL045W-A 288 nt2.26□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YBR032WYBR032W 303 nt2.26□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 SNC2YOR327C 348 nt2.26□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.26□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 COX1Q0045 1605 nt2.25□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 CDC53YDL132W 2448 nt2.25□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YDR250CYDR250C 276 nt2.25□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 HUR1YGL168W 333 nt2.25□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 PAU14YIL176C 363 nt2.25□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 PAU1YJL223C 363 nt2.25□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 CRM1YGR218W 3255 nt2.25□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 VPH1YOR270C 2523 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YKL202WYKL202W 582 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 RPS22BYLR367W 393 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YOR333CYOR333C 417 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 EGD1YPL037C 474 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 SCP160YJL080C 3669 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 SPC72YAL047C 1869 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YEF3YLR249W 3135 nt2.24□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 RRT1YBL048W 312 nt2.23□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 PRM3YPL192C 402 nt2.23□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YPR177CYPR177C 372 nt2.23□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 VPS35YJL154C 2835 nt2.23□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 SGD1YLR336C 2700 nt2.23□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 VTC3YPL019C 2508 nt2.23□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 TRL1YJL087C 2484 nt2.23□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 RIC1YLR039C 3171 nt2.22□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 NUP170YBL079W 4509 nt2.22□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.22□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 RPS18BYML026C 441 nt2.22□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 MSS18YPR134W 807 nt2.22□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 VMR1YHL035C 4779 nt2.22□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 SWT1YOR166C 1377 nt2.22□□□□□ -2.05
NMD4Q12129 CRG1YHR209W 876 nt2.21□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 FYV12YOR183W 390 nt2.21□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 MNE1YOR350C 1992 nt2.21□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 SPO22YIL073C 2928 nt2.21□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YDR114CYDR114C 303 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YER121WYER121W 345 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YER135CYER135C 393 nt2.2□□□□□ -2.06
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