Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 BRE1YDL074C 2103 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 CSF1YLR087C 8877 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 VPS16YPL045W 2397 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YDR269CYDR269C 324 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YPS5YGL259W 498 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 BIG1YHR101C 1008 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 CDC33YOL139C 642 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 OST2YOR103C 393 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 TRM7YBR061C 933 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 PSK2YOL045W 3306 nt2.05□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 KSP1YHR082C 3090 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YER135CYER135C 393 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 ECM25YJL201W 1800 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YJR079WYJR079W 330 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 TEN1YLR010C 483 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YPL039WYPL039W 951 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 NSL1YPL233W 651 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 SAC3YDR159W 3906 nt2.04□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YFR016CYFR016C 3702 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 GIS1YDR096W 2685 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 ANS1YHR126C 480 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YHR138CYHR138C 345 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 TPM2YIL138C 486 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 NFU1YKL040C 771 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YKL063CYKL063C 504 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 RPS17AYML024W 411 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 snR54snR54 86 nt2.03□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RTR2YDR066C 591 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 IES5YER092W 378 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RAD6YGL058W 519 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RRF1YHR038W 693 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 NOP15YNL110C 663 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YOL159CYOL159C 516 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 PES4YFR023W 1836 nt2.02□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 PPN1YDR452W 2025 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 SNU114YKL173W 3027 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 ASG1YIL130W 2895 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 BNI1YNL271C 5862 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 CBS1YDL069C 690 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YHR125WYHR125W 306 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 SPC1YJR010C-A 285 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 DGR1YNL130C-A 147 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YBR277CYBR277C 402 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RNH70YGR276C 1662 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 AFI1YOR129C 2682 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 SNX41YDR425W 1878 nt2.01□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 UTP13YLR222C 2454 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YPK1YKL126W 2043 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RPL29YFR032C-A 180 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 PEP8YJL053W 1140 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 STH1YIL126W 4080 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 MET18YIL128W 3099 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YNL034WYNL034W 1839 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 TOF1YNL273W 3717 nt2□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 ATG31YDR022C 591 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 SWF1YDR126W 1011 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 SMB1YER029C 591 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YFR056CYFR056C 369 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 VTI1YMR197C 654 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 DAD3YBR233W-A 285 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RGA1YOR127W 3024 nt1.99□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 TSA2YDR453C 591 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 NBL1YHR199C-A 222 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RMP1YLR145W 606 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YOR248WYOR248W 303 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YPL080CYPL080C 327 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 ATP15YPL271W 189 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 TAE2YPL009C 3117 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 DPB11YJL090C 2295 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 IRC8YJL051W 2469 nt1.98□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YOL098CYOL098C 3114 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 IST2YBR086C 2841 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 IRC4YDR540C 540 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 CMS1YLR003C 876 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YML084WYML084W 309 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 UBC7YMR022W 498 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 URA10YMR271C 684 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RPS7BYNL096C 573 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 YBR032WYBR032W 303 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 UBR1YGR184C 5853 nt1.97□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RTT107YHR154W 3213 nt1.96□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 ECM5YMR176W 4236 nt1.96□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 TOR1YJR066W 7413 nt1.96□□□□□ -2.09
YPQ1Q12010 RPB11YOL005C 363 nt1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.3 ms