Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 BNI4YNL233W 2679 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 EGD1YPL037C 474 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YPR014CYPR014C 330 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 ROX1YPR065W 1107 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 INO80YGL150C 4470 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 VPS13YLL040C 9435 nt2.61□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 snR65snR65 100 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YDR102CYDR102C 333 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 RPL37AYLR185W 267 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 TIM18YOR297C 579 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 SIR3YLR442C 2937 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.6□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 ATP17YDR377W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 TIF35YDR429C 825 nt2.59□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.59□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 ATP3YBR039W 936 nt2.59□□□□□ -1.99
DSE3Q08729 ESC1YMR219W 4977 nt2.59□□□□□ -2
DSE3Q08729 SUL1YBR294W 2580 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 SMY2YBR172C 2223 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 SNX41YDR425W 1878 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 TOR1YJR066W 7413 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 SVL3YPL032C 2478 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 TSA2YDR453C 591 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 ERG28YER044C 447 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 YKL111CYKL111C 336 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 YKU80YMR106C 1890 nt2.58□□□□□ -2
DSE3Q08729 SAP190YKR028W 3102 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 snR8snR8 190 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 YFL032WYFL032W 321 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 AYR1YIL124W 894 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 YJL202CYJL202C 348 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 YAR029WYAR029W 225 nt2.57□□□□□ -2
DSE3Q08729 RPS22BYLR367W 393 nt2.56□□□□□ -2
DSE3Q08729 CCW14YLR390W-A 717 nt2.56□□□□□ -2
DSE3Q08729 ISU1YPL135W 498 nt2.56□□□□□ -2
DSE3Q08729 YEF3YLR249W 3135 nt2.56□□□□□ -2
DSE3Q08729 ATG11YPR049C 3537 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 HMRA2YCR096C 360 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 OST1YJL002C 1431 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 TIM8YJR135W-A 264 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 NUP170YBL079W 4509 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 BIL1YOR304C-A 231 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 NDD1YOR372C 1665 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 ORC2YBR060C 1863 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 YPL238CYPL238C 390 nt2.55□□□□□ -2
DSE3Q08729 SAK1YER129W 3429 nt2.54□□□□□ -2
DSE3Q08729 BAT1YHR208W 1182 nt2.54□□□□□ -2
DSE3Q08729 PGA1YNL158W 597 nt2.54□□□□□ -2
DSE3Q08729 ATP15YPL271W 189 nt2.54□□□□□ -2
DSE3Q08729 snR36snR36 182 nt2.54□□□□□ -2
DSE3Q08729 RLI1YDR091C 1827 nt2.54□□□□□ -2
DSE3Q08729 KRE33YNL132W 3171 nt2.53□□□□□ -2
DSE3Q08729 ATP22YDR350C 2055 nt2.53□□□□□ -2
DSE3Q08729 CAJ1YER048C 1176 nt2.53□□□□□ -2
DSE3Q08729 URM1YIL008W 300 nt2.53□□□□□ -2
DSE3Q08729 MSL1YIR009W 336 nt2.53□□□□□ -2
DSE3Q08729 snR191snR191 274 nt2.53□□□□□ -2
DSE3Q08729 BIT61YJL058C 1632 nt2.53□□□□□ -2
DSE3Q08729 SSE1YPL106C 2082 nt2.53□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 FAR11YNL127W 2862 nt2.52□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YSW1YBR148W 1830 nt2.52□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 CLN3YAL040C 1743 nt2.52□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 RPS24AYER074W 408 nt2.52□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.52□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 RPS29AYLR388W 171 nt2.52□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 STE5YDR103W 2754 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 PRE4YFR050C 801 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 HOP2YGL033W 657 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 SHE2YKL130C 741 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YLR031WYLR031W 561 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YMR320WYMR320W 306 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 SWD3YBR175W 948 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 INP53YOR109W 3324 nt2.51□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 TFC3YAL001C 3483 nt2.5□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YNL034WYNL034W 1839 nt2.5□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.5□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 YFR056CYFR056C 369 nt2.5□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 NCE101YJL205C 162 nt2.5□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 ATP7YKL016C 525 nt2.5□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 COX1Q0045 1605 nt2.5□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 SPB1YCL054W 2526 nt2.49□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 TFB1YDR311W 1929 nt2.49□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 GCN4YEL009C 846 nt2.49□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 MCM22YJR135C 720 nt2.49□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 KTI11YBL071W-A 249 nt2.49□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 PHO2YDL106C 1680 nt2.49□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 PUT3YKL015W 2940 nt2.49□□□□□ -2.01
DSE3Q08729 UBP1YDL122W 2430 nt2.48□□□□□ -2.01
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