Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 CDC50YCR094W 1176 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 HYP2YEL034W 474 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 MSL1YIR009W 336 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 YLR171WYLR171W 390 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 DDR48YMR173W 1293 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 SIP18YMR175W 240 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 ATP15YPL271W 189 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 ROX1YPR065W 1107 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 YFR016CYFR016C 3702 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 BNR1YIL159W 4128 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 CSF1YLR087C 8877 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 RPC10YHR143W-A 213 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 YLR379WYLR379W 375 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 YML108WYML108W 318 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 SPF1YEL031W 3648 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 SOK2YMR016C 2358 nt2.53□□□□□ -2
SSP2Q08646 ASM4YDL088C 1587 nt2.53□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 BNI1YNL271C 5862 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YCR001WYCR001W 315 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 MRP10YDL045W-A 288 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 BRE1YDL074C 2103 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YFH1YDL120W 525 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 TIM9YEL020W-A 264 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 BI2Q0110 1272 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YJL007CYJL007C 315 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 PET191YJR034W 327 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 UTP30YKR060W 825 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YLR031WYLR031W 561 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 VTI1YMR197C 654 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 AFI1YOR129C 2682 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 RVS161YCR009C 798 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 VOA1YGR106C 798 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 NCE101YJL205C 162 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 GRX8YLR364W 330 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 RPS17AYML024W 411 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 IPT1YDR072C 1584 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 MLH1YMR167W 2310 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.5□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.5□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 ECL1YGR146C 636 nt2.5□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 IRC19YLL033W 693 nt2.5□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 CDC53YDL132W 2448 nt2.5□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 RNH70YGR276C 1662 nt2.5□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 SAP185YJL098W 3177 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YKR078WYKR078W 1758 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 PEP1YBL017C 4740 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 SYM1YLR251W 594 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YOR248WYOR248W 303 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 ATP3YBR039W 936 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 snR54snR54 86 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 NIC96YFR002W 2520 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 FAB1YFR019W 6837 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 NOP10YHR072W-A 177 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 SNC1YAL030W 354 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YAR068WYAR068W 486 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 GIP3YPL137C 3831 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 BFA1YJR053W 1725 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 CRM1YGR218W 3255 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 PPN1YDR452W 2025 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 DNF1YER166W 4716 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 MET18YIL128W 3099 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 VAR1Q0140 1197 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 RUF22RUF22 515 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 SPC29YPL124W 762 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 MUD2YKL074C 1584 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 TRA1YHR099W 11235 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP2Q08646 YPR097WYPR097W 3222 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 IRA2YOL081W 9240 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 SMD1YGR074W 441 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YHR125WYHR125W 306 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 TSC3YBR058C-A 243 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 RPB5YBR154C 648 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 VPS52YDR484W 1926 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YDL041WYDL041W 354 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 ATP17YDR377W 306 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YPL205CYPL205C 345 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 IRC10YOL015W 1761 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 SPC72YAL047C 1869 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 UBR1YGR184C 5853 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 VPH1YOR270C 2523 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 MSS11YMR164C 2277 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YJR157WYJR157W 363 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 AIM29YKR074W 468 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 TOM22YNL131W 459 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YPR039WYPR039W 336 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 YOL098CYOL098C 3114 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 SIR4YDR227W 4077 nt2.43□□□□□ -2.02
SSP2Q08646 ANS1YHR126C 480 nt2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.8 ms