Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS1P54277 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS1P54277 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS1P54277 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS1P54277 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS1P54277 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS1P54277 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS1P54277 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS1P54277 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS1P54277 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS1P54277 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms