Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 RTT102YGR275W 474 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS4P48567 GRX8YLR364W 330 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS4P48567 GOT1YMR292W 417 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS4P48567 YMR320WYMR320W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS4P48567 YBL108WYBL108W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS4P48567 YOR121CYOR121C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS4P48567 PFF1YBR074W 2931 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS4P48567 SAP1YER047C 2694 nt2.59□□□□□ -2
PUS4P48567 ESL1YIL151C 3357 nt2.59□□□□□ -2
PUS4P48567 INP51YIL002C 2841 nt2.59□□□□□ -2
PUS4P48567 MSL5YLR116W 1431 nt2.59□□□□□ -2
PUS4P48567 CDC20YGL116W 1833 nt2.58□□□□□ -2
PUS4P48567 CDC50YCR094W 1176 nt2.58□□□□□ -2
PUS4P48567 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.58□□□□□ -2
PUS4P48567 GIS1YDR096W 2685 nt2.58□□□□□ -2
PUS4P48567 BNR1YIL159W 4128 nt2.58□□□□□ -2
PUS4P48567 INP53YOR109W 3324 nt2.57□□□□□ -2
PUS4P48567 EDS1YBR033W 2760 nt2.57□□□□□ -2
PUS4P48567 NAN1YPL126W 2691 nt2.57□□□□□ -2
PUS4P48567 YDR209CYDR209C 414 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 TMA22YJR014W 597 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 FCF2YLR051C 654 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 RPL6AYML073C 531 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 SUL1YBR294W 2580 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 VPS41YDR080W 2979 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 SHQ1YIL104C 1524 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 GCD6YDR211W 2139 nt2.56□□□□□ -2
PUS4P48567 CDC24YAL041W 2565 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 YER121WYER121W 345 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 TWF1YGR080W 999 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 NOP10YHR072W-A 177 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 PAU14YIL176C 363 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 PAU1YJL223C 363 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 YPL238CYPL238C 390 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 SGD1YLR336C 2700 nt2.55□□□□□ -2
PUS4P48567 PRK1YIL095W 2433 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 JIP5YPR169W 1479 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 YGL024WYGL024W 336 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 YGR035CYGR035C 351 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 SNC1YAL030W 354 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 SNC2YOR327C 348 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 POL3YDL102W 3294 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 VPS64YDR200C 1815 nt2.54□□□□□ -2
PUS4P48567 YEL043WYEL043W 2871 nt2.53□□□□□ -2
PUS4P48567 SDC1YDR469W 528 nt2.53□□□□□ -2
PUS4P48567 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.53□□□□□ -2
PUS4P48567 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.53□□□□□ -2
PUS4P48567 PRE8YML092C 753 nt2.53□□□□□ -2
PUS4P48567 KAP123YER110C 3342 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS4P48567 PCF11YDR228C 1881 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS4P48567 AFI1YOR129C 2682 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YJR011CYJR011C 786 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS4P48567 SNF5YBR289W 2718 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS4P48567 CBF2YGR140W 2871 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 TOP2YNL088W 4287 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 DOT6YER088C 2013 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YHL005CYHL005C 393 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 RPS20YHL015W 366 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YML003WYML003W 873 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 RPL9BYNL067W 576 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 GIP3YPL137C 3831 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS4P48567 VMR1YHL035C 4779 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YKU80YMR106C 1890 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 SMD1YGR074W 441 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YLR012CYLR012C 300 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 COA4YLR218C 453 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 RPS29AYLR388W 171 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 PGA1YNL158W 597 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 LCL1YPL056C 306 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 FAR11YNL127W 2862 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YIL169CYIL169C 2988 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 SKP2YNL311C 2292 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 IKI3YLR384C 4050 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 UBR1YGR184C 5853 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 RGA2YDR379W 3030 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YDR239CYDR239C 2364 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YIL080WYIL080W 4722 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 RAV1YJR033C 4074 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 QCR7YDR529C 384 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 HMF1YER057C 390 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 SWT1YOR166C 1377 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS4P48567 SAK1YER129W 3429 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS4P48567 KEL2YGR238C 2649 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YJR003CYJR003C 1560 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YJR098CYJR098C 1971 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 SGS1YMR190C 4344 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 NFT1YKR103W 3657 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 MSL1YIR009W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 VTI1YMR197C 654 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 YPL182CYPL182C 384 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 ACM1YPL267W 630 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 VPS35YJL154C 2835 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 RIC1YLR039C 3171 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS4P48567 CRM1YGR218W 3255 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YDL011CYDL011C 324 nt2.46□□□□□ -2.02
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