Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms