Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 KAP122YGL016W 3246 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 CUP9YPL177C 921 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 MTC7YEL033W 420 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 PET123YOR158W 957 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 CSE1YGL238W 2883 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YFR056CYFR056C 369 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YIL012WYIL012W 342 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YAR068WYAR068W 486 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 CTK3YML112W 891 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 NSL1YPL233W 651 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 snR35snR35 204 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-8P0CX22 SPC1YJR010C-A 285 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 DYN3YMR299C 939 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 RLM1YPL089C 2031 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 CMC2YBL059C-A 330 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YPR063CYPR063C 423 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 CDC5YMR001C 2118 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 ESA1YOR244W 1338 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YCR015CYCR015C 954 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YJL022WYJL022W 309 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 VPS55YJR044C 423 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YBR063CYBR063C 1215 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 TCA17YEL048C 459 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 FYV4YHR059W 393 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 MER1YNL210W 813 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YBR032WYBR032W 303 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YLL054CYLL054C 2532 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 NSE4YDL105W 1209 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 AI3Q0060 1248 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 IES5YER092W 378 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 CSI2YOL007C 1026 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 SNC2YOR327C 348 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 NSE3YDR288W 912 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YGL039WYGL039W 1047 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YNR068CYNR068C 819 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 PEP3YLR148W 2757 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 RIF2YLR453C 1188 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 COX1Q0045 1605 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 BFR1YOR198C 1413 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-8P0CX22 YAP3YHL009C 993 nt0.59□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 AIM41YOR215C 558 nt0.59□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YDR042CYDR042C 603 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YFR054CYFR054C 579 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YMR147WYMR147W 672 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YNL089CYNL089C 477 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YOR152CYOR152C 771 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 ADF1YCL058W-A 342 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 AZF1YOR113W 2745 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 MDM36YPR083W 1740 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 NIP100YPL174C 2607 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 BTN2YGR142W 1233 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 RPL40AYIL148W 387 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 CYB5YNL111C 363 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 PEX15YOL044W 1152 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 ALK1YGL021W 2283 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 PRS3YHL011C 963 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 snR14snR14 160 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 ARL3YPL051W 597 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 MRPL40YPL173W 894 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 DGR2YKL121W 2559 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YDR286CYDR286C 345 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 RAM2YKL019W 951 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 FUS2YMR232W 2034 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 PSO2YMR137C 1986 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 NCA2YPR155C 1851 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 HOP2YGL033W 657 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YAL069WYAL069W 315 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YPR014CYPR014C 330 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 ENV11YGR071C 2583 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 MVP1YMR004W 1536 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 SMD1YGR074W 441 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 RPB5YBR154C 648 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 SAS3YBL052C 2496 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 MFA1YDR461W 111 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 YGR250CYGR250C 2346 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 NUP120YKL057C 3114 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-8P0CX22 MUK1YPL070W 1839 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 RIM20YOR275C 1986 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 NOP12YOL041C 1380 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 RPL35BYDL136W 363 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 YIL141WYIL141W 390 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 MRPL24YMR193W 777 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 RRT16YNL105W 429 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 SST2YLR452C 2097 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 RPL9AYGL147C 576 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-8P0CX22 AHC2YCR082W 387 nt0.5□□□□□ -2.33
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