Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFLP07196 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFLP07196 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFLP07196 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFLP07196 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms