Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QLW9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QLW9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QLW9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QLW9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QLW9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms