Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNIKQ9UKE5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms