Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC82Q8N4S0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.1 ms