Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
EEA1Q15075 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms