Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YIL082WYIL082W 873 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 ATP7YKL016C 525 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YLR217WYLR217W 324 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 URK1YNR012W 1506 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 BRO1YPL084W 2535 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 SPO22YIL073C 2928 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 BTT1YDR252W 450 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 FAR7YFR008W 666 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 RPL29YFR032C-A 180 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YGL069CYGL069C 465 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 LSM2YBL026W 288 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YOR392WYOR392W 444 nt1.59□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 PGD1YGL025C 1194 nt1.58□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 RPI1YIL119C 1224 nt1.58□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YLR302CYLR302C 363 nt1.58□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 GAL80YML051W 1308 nt1.58□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 SEC63YOR254C 1992 nt1.58□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YER158W-AYER158W-A 216 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YGL042CYGL042C 306 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 CWC23YGL128C 852 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 AIM18YHR198C 966 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 GRX8YLR364W 330 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 PDP3YLR455W 915 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 ERG29YMR134W 714 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YNL010WYNL010W 726 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 BRX1YOL077C 876 nt1.57□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 TDA9YML081W 3756 nt1.56□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YDR248CYDR248C 582 nt1.56□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 NCE101YJL205C 162 nt1.56□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 CYB5YNL111C 363 nt1.56□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 ARP7YPR034W 1434 nt1.56□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.56□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 PET127YOR017W 2403 nt1.56□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 CCH1YGR217W 6120 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 snR59snR59 78 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 MZM1YDR493W 372 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YIP1YGR172C 747 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 ATP18YML081C-A 180 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 SPE1YKL184W 1401 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 SHE4YOR035C 2370 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 RIC1YLR039C 3171 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 VMR1YHL035C 4779 nt1.55□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YDR115WYDR115W 318 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 TDA2YER071C 381 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 TAD1YGL243W 1203 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 BUD19YJL188C 309 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 LCL2YLR104W 396 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YPT6YLR262C 648 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YOR105WYOR105W 327 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 MEC1YBR136W 7107 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 MSH6YDR097C 3729 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YOR019WYOR019W 2193 nt1.54□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 SPC110YDR356W 2835 nt1.53□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 YDR042CYDR042C 603 nt1.53□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 ATP17YDR377W 306 nt1.53□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.53□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 LAG1YHL003C 1236 nt1.53□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 SEY1YOR165W 2331 nt1.53□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 PLC1YPL268W 2610 nt1.53□□□□□ -2.16
MSH5Q12175 HSL1YKL101W 4557 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 CFT1YDR301W 4074 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 IRC2YDR112W 309 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 DAD4YDR320C-A 219 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 CAJ1YER048C 1176 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 TPM2YIL138C 486 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 PEP8YJL053W 1140 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 TMA10YLR327C 261 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 FYV8YGR196C 2454 nt1.52□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 POL5YEL055C 3069 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 RPL31AYDL075W 342 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YGR115CYGR115C 780 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 BET4YJL031C 984 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 HSK3YKL138C-A 210 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YLR031WYLR031W 561 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 SEN15YMR059W 387 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 TAZ1YPR140W 1146 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 CDC27YBL084C 2277 nt1.51□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YDR537CYDR537C 606 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 DFG10YIL049W 762 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 SNC2YOR327C 348 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YOR364WYOR364W 369 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 SPC29YPL124W 762 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 CHS1YNL192W 3396 nt1.5□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.49□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 GIC1YHR061C 945 nt1.49□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 ACF4YJR083C 930 nt1.49□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 TRX1YLR043C 312 nt1.49□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YOR146WYOR146W 306 nt1.49□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 ADR1YDR216W 3972 nt1.49□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 NOP53YPL146C 1368 nt1.48□□□□□ -2.17
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