Protein–RNA interactions for Protein: P47108

URB2, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URB2P47108 SMB1YER029C 591 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 ACB1YGR037C 264 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 LAG1YHL003C 1236 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 BIG1YHR101C 1008 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 TIM8YJR135W-A 264 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 EMC6YLL014W 327 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 NOP15YNL110C 663 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 RPB11YOL005C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 YPR089WYPR089W 2667 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 YNL018CYNL018C 1839 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 SLN1YIL147C 3663 nt2.37□□□□□ -2.03
URB2P47108 LEU3YLR451W 2661 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 GDS1YOR355W 1569 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 BAS1YKR099W 2436 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 GPI8YDR331W 1236 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 YIL058WYIL058W 285 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 YKL202WYKL202W 582 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 YLR269CYLR269C 351 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 YML108WYML108W 318 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 RRP12YPL012W 3687 nt2.36□□□□□ -2.03
URB2P47108 YJL181WYJL181W 1836 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 MDM32YOR147W 1869 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 HSC82YMR186W 2118 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 CBF2YGR140W 2871 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 YGR042WYGR042W 816 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 RMP1YLR145W 606 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 YMR320WYMR320W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 SAP185YJL098W 3177 nt2.35□□□□□ -2.03
URB2P47108 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.34□□□□□ -2.03
URB2P47108 RPL37AYLR185W 267 nt2.34□□□□□ -2.03
URB2P47108 PRM3YPL192C 402 nt2.34□□□□□ -2.03
URB2P47108 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.34□□□□□ -2.03
URB2P47108 PRK1YIL095W 2433 nt2.34□□□□□ -2.03
URB2P47108 TOR2YKL203C 7425 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 KSP1YHR082C 3090 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 TEN1YLR010C 483 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 ICY1YMR195W 384 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 CMC2YBL059C-A 330 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 MSS18YPR134W 807 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 YBR277CYBR277C 402 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 VMA9YCL005W-A 222 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 SSD1YDR293C 3753 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 PES4YFR023W 1836 nt2.33□□□□□ -2.04
URB2P47108 RNH70YGR276C 1662 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 CLN3YAL040C 1743 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 YRB1YDR002W 606 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 AAD16YFL057C 459 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 TWF1YGR080W 999 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 RPC10YHR143W-A 213 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 RPL40AYIL148W 387 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 YLR031WYLR031W 561 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 CCW14YLR390W-A 717 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 TIF11YMR260C 462 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 CDC33YOL139C 642 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 DGK1YOR311C 873 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 VPS16YPL045W 2397 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 DNA2YHR164C 4569 nt2.32□□□□□ -2.04
URB2P47108 YDL032WYDL032W 312 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YFH1YDL120W 525 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 ECL1YGR146C 636 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 RAM2YKL019W 951 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YLR101CYLR101C 396 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YLR458WYLR458W 381 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YOR248WYOR248W 303 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.31□□□□□ -2.04
URB2P47108 UBR1YGR184C 5853 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 TIM9YEL020W-A 264 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 HUR1YGL168W 333 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 CRG1YHR209W 876 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 NCE101YJL205C 162 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 PET191YJR034W 327 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 IRC19YLL033W 693 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 YNL324WYNL324W 396 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 YOR105WYOR105W 327 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 BRO1YPL084W 2535 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 SMC6YLR383W 3345 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 INP53YOR109W 3324 nt2.3□□□□□ -2.04
URB2P47108 STH1YIL126W 4080 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 SDC1YDR469W 528 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 RPL27BYDR471W 411 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 YHR125WYHR125W 306 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 PAU8YAL068C 363 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 SIP18YMR175W 240 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 DGR1YNL130C-A 147 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 PAU20YOL161C 363 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 RSA1YPL193W 1146 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 snR54snR54 86 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 NUP170YBL079W 4509 nt2.29□□□□□ -2.04
URB2P47108 NUP82YJL061W 2142 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.5 ms